The Impact of Selected Gene Mutations to the Activation and DNA Binding Activity of the Transcription Factor VraR
Notice bibliographique
Résumé
VraSR two-component system in S. aureus senses bacterial cell wall damage caused by antibiotics (vancomycin or -lactams) and regulates a set of genes. We have undertaken the study of the role of certain amino acids in the function of VraR, which undergo mutation in clinical S. aureus resistant strains and analyzed their effects on the VraSR signal transduction mechanism. In particular, we have looked at the role of Met-13 in VraR phosphorylation induced activation. M13A failure to be activated by phosphorylation resulted in a weaker binding to DNA. Moreover, we investigated VraR E59D, S164P, A113V, and S164A binding activity to the PvraSR by DNase-I footprinting. Finally, in vivo studies on the effects of substitutions of the above residues on the mRNA level of a number of VraSR regulon genes (fmtA, pbp2, and sgtb) provide insights as to how substitutions at certain positions may be beneficial to the S. aureus resistance to antibiotics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».