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Enregistrement W7066764790

Investigating a novel CTRP8-DLK1 interaction and its impact on glioma stemness

2023· dissertation· en· W7066764790 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Physics and Python Applications
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGliomaCell cultureRegulatorStem cellFunction (biology)GlioblastomaSignal transductionTranscription factor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The C1Q-tumor necrosis factor related protein (CTRP) family has functions in metabolism, immunity, and cancer. Among the CTRP family, CTRP8 remains the least well characterized in terms of function and receptors. In the brain tumor glioblastoma (GBM), CTRP8 impacts migration and treatment resistance through its receptor RXFP1. We investigate a new interaction between CTRP8 and the EGF-like protein Delta-like homolog 1 (DLK1). DLK1 is a well-known regulator of differentiation and is considered a marker of stemness in several cancers. In GBM, elevated DLK1 expression promotes migration, stemness and has been correlated with poor prognosis. There is interest in further understanding complex mechanisms of DLK1 in a cancer context. Methodology: A yeast-two hybrid (Y2H) screen and co-immunoprecipitation (co-IP) were used to characterize CTRP8-DLK1 interaction domains. The U251 cell line was used to assess stemness using tumor sphere formation and glioma stem cell (GSC) marker expression. In the same U251 model we investigate mechanisms responsive to CTRP8-DLK1 that regulate GSCs. Results: The Y2H identified DLK1 as a CTRP8 interaction partner. In co-IP CTRP8 binds full-size DLK1 and a truncated, soluble form of DLK1. DLK1 enhanced sphere formation and GSC marker expression in U251. The pro-stemness effect of DLK1 was counteracted by CTRP8, resulting in an overall reduction in stemness. Reduced stemness in cells expressing a cleavage-resistant DLK1 form revealed potential functions of DLK1 cleavage products as factors regulating the GSC population. In U251 cells expressing DLK1, CTRP8 treatment increased DLK1 intracellular domain (ICD) release and nuclear translocation. DLK1 ICD may act as a transcriptional co-factor revealing a new function for DLK1 ICD. Conclusions: This is the first study describing CTRP8 as a DLK1 ligand. Our findings reveal DLK1 as a promoter of glioma stemness, and CTRP8 as an antagonist. The CTRP8-DLK1 interaction may be part of a novel regulatory system impacting the glioma stem cell niche that can be of clinical relevance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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