Microbial biodiversity of high Arctic wetland cryosolic soils and development of phylogenetic microarrays for polar applications
Notice bibliographique
Résumé
This thesis consisted of two studies: the microbial biodiversity of Arctic wetland cryosol and the testing of two phylogenetic microarrays using environmental samples from the Canadian high Arctic. The first involved culture-independent and dependent analyses which assessed the diversity and structure of cryosol microorganisms. Active layer communities were distinct from permafrost communities in DGGE profiles, 16S rRNA gene clone libraries for Bacteria and Archaea and total cell enumerations and viable cell counts. Findings suggest novel aspects of Arctic wetland permafrost soil compared to previously studies. Comparisons to other Arctic permafrost and more temperate wetland 16S rRNA gene clones demonstrated the existence of common features of cold-adapted communities and Arctic wetlands. The second study was to compare characterizations from two phylogenetic microarrays (PGMAs) against 6 previously constructed clone libraries from high Arctic sites. A general environmental PGMA (GE.10) and a PGMA specifically for cyro-environments (Cryo-PGMA) were tested. The combined data, or "dual-PGMA", had moderate coverage of the taxa identified in clone libraries (51%) and detected corresponding genera at a relatively low rate (26%). The dual-PGMA demonstrated capability of reproducing broad phylogenetic community structures identified in clone libraries and contributed additional taxonomic detail not found there. The dual-PGMA had comparable sensitivity to other PGMA platforms and detected taxa occupying 0.6% of the total clone library. Principle coordinate analysis grouped communities from similar geographical and physical environments. The dual-PGMA demonstrated a capacity for profiling patterned differences in microbial communities while providing general approximations of taxonomic structure.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».