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Enregistrement W7067788522

Molecular characterization of rat cardiac sarcolemmal Ca2S+/Mg2S+ ecto-ATPase

2007· other· en· W7067788522 sur OpenAlexfundvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2007
Typeother
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésComplementary DNAMolecular massAntiserumPeptide sequenceMolecular cloningcDNA librarySkeletal muscleAmino acidPolyclonal antibodies
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sarcolemmal Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase (Myoglein; MW 180 kD) is a membrane bound enzyme which requires millimolar concentrations of either Ca$\\sp{2+}$ or Mg$\\sp{2+}$ for maximal hydrolysis of ATP. In order to elucidate the structural and functional properties of the rat cardiac sarcolemmal Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase, this protein was purified to homogeneity and utilized for the biophysical, molecular and immunochemical characterization. Mass spectroscopic analysis of the enzyme using different matrix combinations revealed the presence of multi-components indicating microheterogeneity in the protein structure. Treatment of the ecto-ATPase with DL-dithiothreitol did not alter the pattern of mass spectroscopic analysis and this indicated that the microheterogeneity may be due to some posttranslational modifications. For determining the molecular structural properties, the purified Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase was subjected to tryptic digestion and amino acid sequencing. The amino acid sequence was utilized to design an oligonucleotide probe. Screening of a rat heart cDNA library produced a partial cDNA clone (pND2.1) that was 100% homologous to human platelet CD36. A high degree of homology ($>$70%) with other cell adhesion molecules was also noted. The oligomer probe detected a 4.4 kB transcript in heart, brain, spleen, lung, liver, skeletal muscle, kidney, and testis. An additional 3.1 kB transcript was detectable in heart, lung, liver and skeletal muscle while transcripts of $\\sim$2.0 kB and $\\sim$1.0 kB were also evident in the heart whereas ND2.1 detected a $\\sim$3.1 kB transcript in cardiac tissue. To determine the immunochemical properties of the rat cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase, a polyclonal antiserum was raised against purified $\\rm Ca\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase. As assessed by Western blot analysis, the antiserum as well as the purified immunoglobulin were specific for Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ATPase; no crossreaction was observed towards other membrane bound enzymes such as rat sarcoplasmic reticulum Ca$\\sp{2+}$-pump ATPase or plasma membrane Ca$\\sp{2+}$-pump ATPase On the other hand, the cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ATPase was not recognized by either rat SR Ca$\\sp{2+}$ ATPase or liver ecto-ATPase (Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ATPase) antibodies. In this study, we have produced an antiserum which is specific for plasma membrane Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase in cardiocytes. This antiserum can localize the plasma membrane of cardiomyocytes as well as brain, skeletal muscle, liver and kidney. Western immunoblots revealed that a polyclonal antiserum raised against the purified cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase in rabbit recognized the CD36 molecule, whereas a monoclonal antibody directed against human CD36 cross-reacted with cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase, in cardiac plasma membrane preparation. On the basis of these observations, the role of the Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase in cell adhesion phenomenon was tested by carrying out a cell-cell adhesion bioassay in neonatal cardiomyocyte culture. The purified IgG fraction of the anti-cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase serum was found to depress the spreading and attachment of cardiomyocytes to their substratum. These results suggest that the rat cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase is an acidic protein having two subunits. Furthermore, Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase shows microheterogeneity in its molecular structure. It is concluded that rat cardiac Ca$\\sp{2+}$/Mg$\\sp{2+}$ ecto-ATPase may either contain a fragment with cell adhesion properties or is tightly associated with a protein which is homologous to the adhesion molecule CD36. (Abstract shortened by UMI.)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,150
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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