PCR-RFLP PARA LA DETECCIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE CIRCOVIRUS PORCINO TIPO 2 (PCV2) EN GRANJAS VENEZOLANAS
Notice bibliographique
Résumé
El circovirus porcino tipo 2 (PCV2: Por sus siglas \nen inglés) se ha reconocido como el agente causal d\nel\nsíndrome multisistémico de emaciación postdestete (\nPMWS, por sus siglas en inglés; Postweaning\nmultisystemic wasting syndrome). El PMWS fue primer\no descrito en Canadá y reportado como enfermedad\nemergente en granjas de cerdos de todo el mundo. En \nVenezuela esta enfermedad fue diagnosticada en\npiaras de la región central del país en el año 2003\n. Con la finalidad de determinar la presencia del P\nCV2\nen nuestro país, 18 muestras de ganglio inguinal su\nperficial de cerdos con síntomas compatibles con\nPMWS provenientes de los estados Aragua, Lara y Yar\nacuy, fueron analizadas por una reacción en cadena\nde la polimerasa y análisis de polimorfismo del fra\ngmentos de restricción (PCR - RFLP: por sus siglas \nen\ninglés) específica para el marco de lectura abierto\n dos (ORF 2: por sus siglas en inglés) de PCV2. Tod\nas\nlas muestras de tejidos provenientes de cerdos con \nsíntomas de PMWS (18/18) resultaron positivas a\nPCV2 por PCR y la identidad genética de estos virus\n fueron determinada por secuenciación de los\namplicones. Usando una RFLP específica para el ORF2\n del PCV2, se encontró que en las granjas\nanalizadas circulan los subgenotipos 2A y 2D. Este \nestudio constituye el primer reporte de detección y\ngenotipaje de PCV2 en Venezuela utilizando un ensayo\n de PCR - RFLP.br\nPalabras claves del Autor: Circovirus tipo 2, Genotipo, Venezu\nela, RFLP.brbr\n\nABSTRACTbr\nPorcine circovirus type 2 (PCV2) has been recognize\nd as the causative agent of post-weaning multisyste\nmicwasting syndrome (PMWS). PMWS was first described i\nn Canada and reported as an emerging disease in\npig farms worldwide. In Venezuela the disease was d\niagnosed in herds of the midwest in 2003. In order \nto determine the presence of PCV2 in our country, 18 s\namples of superficial inguinal lymph of pigs with\nsymptoms consistent with PMWS from Aragua, Lara and\n Yaracuy states, were analyzed by Polymerase\nChain Reaction and Restriction Fragment Length Poly\nmorphism (PCR - RFLP) specific for Open Reading\nFrame 2 (ORF 2) of PCV2. All samples of tissues fro\nm pigs with PMWS symptoms (18/18) were positive for\nPCV2 by PCR. Using a RFLP analysis specific for ORF\n2 PCV2, the sub-genotypes 2A and 2D were found\ncirculating in the sampled farms. This study is the\n first report of detection and genotyping of PCV2 i\nn\nVenezuela using a PCR - RFLP assay.br\nKey words: Type 2 circovirus, Genotype, Venezuela, \nRFLPbrbr
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».