p66ShcA as a prognostic and mechanistic biomarker for responsiveness to PARP inhibitor combination therapies in poor outcome breast cancers
Notice bibliographique
Résumé
Triple negative breast tumors (TNBC) lack ER, PR, and HER-2 expression and are associated with a poor prognosis.Currently, non-targeted chemotherapy remains the standard of care for these patients.PARP inhibition represented a promising approach for these women.Regrettably, clinical trials have shown limited survival benefit to date and predictive biomarkers of response are lacking.Some cytotoxic agents employed to treat TNBC, and that act in synergy with PARP inhibitors, produce reactive oxygen species (ROS) as part of their mechanism of action.p66ShcA is a redox protein that is differentially expressed in TNBCs.Under steady state conditions, it is cytoplasmic.In response to stress stimuli, p66ShcA is phosphorylated on Ser36, which allows it to translocate to the mitochondria where it promotes the formation of ROS.I hypothesize that the expression of p66ShcA will sensitize TNBC cell lines to the combination of PARPi and chemotherapy.To this end, p66ShcA was deleted from the genome of two TNBC cell lines by Crispr-Cas9 genomic editing.Wild-type p66ShcA or a mutant (p66ShcA-QQW), which is unable to generate ROS, were re-expressed along with the empty backbone (VC).Cell lines were subjected to cell viability assays, DNA damage assessment and oxidative damage determination upon treatment with PARPi (Niraparib), in combination with Doxorubicin, each at sub-optimal doses.p66ShcA-WT and VC breast cancer cell lines were also injected in the mammary fat pad of SCID-BEIGE mice.Animals were randomized into four groups: Niraparib alone, Doxorubicin alone, Niraparib/Doxorubicin combination therapy and vehicle control.p66ShcA sensitized TNBC cell lines to Doxorubicin/PARPi combination therapies in vitro and in vivo as a result of an increased oxidative stress.This difference in viability is the result of the cytolytic effect of p66ShcA-induced ROS formation and is not dependent on increased induction of DNA damage. AbrégéLes cancers du sein de type triple négatifs (TNBC) sont dépourvus d'expression de ER, PR et HER-2 et sont associés à des pronostics défavorables.Actuellement, la chimiothérapie non-ciblée reste la norme en matière de traitement pour ces patientes.L'inhibition de PARP a représenté une approche prometteuse pour ces femmes.Malheureusement, les essais cliniques ont montré que les bénéfices en termes de hausse du taux de survie étaient limités à ce jour et que les biomarqueurs prédictifs de réponse faisaient défaut.Certains agents cytotoxiques employés pour traiter le TNBC, et qui agissent en synergie avec les inhibiteurs de la PARP, produisent des dérivés réactifs d'oxygène (DRO) dans le cadre de leur mécanisme d'action.Le p66ShcA est une protéine rédox qui s'exprime de manière différentielle dans les TNBC.À l'état stationnaire, il est cytoplasmique.En réponse à des stimuli de stress, le p66ShcA est phosphorylé sur le Ser36, ce qui lui permet de se déplacer vers la mitochondrie où il favorise la formation de DRO.Mon hypothèse est que l'expression de p66ShcA va rendre sensibles les lignées de cellules TNBC à la combinaison de inhibiteurs de PARP et de chimiothérapie.Pour la tester, le p66ShcA a été supprimé du génome de deux lignées de cellules TNBC par manipulation génomique Crispr-Cas9.Le p66ShcA de type naturel, ou un mutant (p66ShcA-QQW) qui est incapable de générer des ROS, a été ré-exprimé avec le plasmide (VC).Les lignées cellulaires ont été soumises à des tests de viabilité cellulaire, à une évaluation des dommages à l'ADN et à une détermination des dommages par oxydation lors d'un traitement avec PARPi (Niraparib), en association avec la doxorubicine, chacune à des doses sousoptimales.Des lignées cellulaires de cancer du sein p66ShcA-WT et VC ont également été injectées dans le tissue adipeux mammaire de souris SCID-BEIGE.Les animaux ont été randomisés en quatre groupes : Niraparib seul, Doxorubicine seule, traitement combiné de Niraparib/Doxorubicine et groupe témoin.Le p66ShcA a rendu sensibles les lignées de cellules TNBC à la thérapie combinée de Doxorubicine/PARPi in vitro et in vivo en raison d'un stress oxydatif accru.Cette différence de viabilité résulte de l'effet cytolytique de la formation de DRO induite par le p66ShcA et ne dépend pas du déclenchement accru de dommages à l'ADN.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».