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Enregistrement W7071267301

Regulation of the peripheral myelin protein-22 gene

2003· dissertation· en· W7071267301 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2003
Typedissertation
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueClay minerals and soil interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneReporter geneTransgeneGene expressionGenetically modified mouseGene targetingLocus (genetics)Peripheral myelin protein 22
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peripheral Myelin Protein-22 (PMP22) is a relatively major component of peripheral nerve myelin. Either missense mutations or duplication of the PMP22 gene can be the cause of Charcot-Marie-Tooth disease type 1 A (CMT1A). The control of PMP22 expression could be a basis for treatment. The aim of my research is to understand the regulation of the PMP22 gene in a transgenic mouse model. Initially, -8.5 kb 5' flanking sequence of the rat Pmp22 gene was used to drive reporter gene expressed in transgenic mice. This construct confers tissue specificity, weak developmental regulation, weakly detectable levels of expression in the dorsal root ganglia (DRG), but not the expected up-regulation during nerve regeneration. Secondly, I generated transgenic mice using -21 kb 5' Pmp22 flanking sequence. This construct confers robust reporter gene expression in the peripheral nervous system (PNS), and little to the DRGs in one line. The other lines show weak expression in the PNS, and stronger expression in the DRGs. Thirdly, I targeted a 21 kb Pmp22 promoter/reporter transgene to the hypoxanthine phosphorybosyl transferase (Hprt) locus in male embryonic stem cells. Using this methodology, I obtained a line carrying -21 kb of Pmp22 promoter driving beta-galactosidase gene in the hprt locus. This line confers expression similar to the four lines derived by pronuclear injection carrying the same construct. Fourthly, I introduced the LacZ reporter gene at the start codon of Pmp22 in a 100 kb bacterial artificial chromosome (BAC). Six transgenic lines were produced and analyzed, showing embryonic and postnatal developmental regulation, and high level of expression in the PNS similar to endogenous Pmp22 expression. From my results and the literature, I suggest that (1) the stretch of -10.5 to -21 kb could carry repressor(s), (2) there is (a) positive element(s) that lie(s) between -8.5 and -10.5 kb, and (3) 3' element(s) are important for Pmp22 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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