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Enregistrement W7071951162

Therapeutic Antimicrobials in Modulation of Gut Health, Growth Performances, Crude Protein and Amino Acid Utilization and Gut Microbiome in Weanling Pigs

2023· dissertation· en· W7071951162 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueExtraction and Separation Processes
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSwine Innovation Porc
Mots-clésWeanlingAntimicrobialChlortetracyclineGut floraAntibioticsMicrobiomeColonisation resistanceAntibiotic resistanceFusobacterium
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibiotics are among the best medicine discoveries. Antimicrobials have been used for enhancing pig gut health and growth performances for the past seven to eight decades but have also contributed to the development of antimicrobial resistance (AMR). The major mode of antimicrobial for growth promotion is often linked to improved efficiency of utilization of dietary crude protein (CP) and amino acids (AA) but with less convincing data and unraveled biological mechanisms. Three studies were conducted to investigate the impacts of therapeutic antimicrobials on modulation of gut health, growth performances, CP and AA utilization and gut microbiome via the high-resolution and high accuracy Loop-SeqTM synthetic full-length 16S-rRNA gene sequencing platform in weanling pigs. Study-1 results showed that therapeutic chlortetracycline dramatically altered (P<0.05) the distal ileal relative abundances of the two most populous bacterial species, i.e., Lactobacillus sp. and Streptococcus sp., respectively. Chlortetracycline was also shown to substantially reduce (P<0.05) the distal ileal relative abundances of the zoonotic Campylobacter lanienae and the pancreatic and colonic carcinogenic Fusobacterium spp. Chlortetracycline improved the weanling pig gut health endpoint by enhancing the distal ileal colonization of the chlortetracycline-producing Streptomyces aureofaciens, providing a new understanding of the antimicrobial resistance associated with this antibiotic. Chlortetracycline could improve (P<0.05) the apparent ileal Lys digestibility via modulating relative abundances of several specific ileal bacterial species; however, it had limited effects (P>0.05) on the efficiency of digestive and post-digestive utilization of dietary CP in the weanling pigs. Thus, high-resolution sequencing the 16S-rRNA gene unravels species-level of the gut microbiome changes in the weanling pigs administered with the therapeutic chlortetracycline in providing important One Health implications to humans. The Study-2 results showed that therapeutic antimicrobials could selectively regulate (P<0.05) host gut gene expression and mediate gut digestibility and AA utilization in the small and the large intestines via modulating relative abundances of some specific bacterial species in the weanling pigs. In Study-3, we discovered that even when the last-resort human therapeutic macrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) antibiotics were never used in the study pigs and their prior source swine herds, the fecal tetracycline resistome core AMR genes and the fecal last-resort human therapeutic MLS antibiotic AMR genes were equally enriched in their relative abundances. And these examined AMR gene abundances were not further enhanced (P>0.05) by the therapeutic tetracycline administration in the weanling pigs. We also found that Syntrophococcus sp. and Enterobacter hormaechei were responsible for explaining the relative abundances of tetM and mcr-1, respectively. Our results support the notion that the elevated AMR gene prevalence and abundances in the porcine commensal and pathogenic bacteria have been reaching plateau levels because of the globe-wide antimicrobial use over the past seven to eight decades. Realistic resistome mitigation strategies should be emphasized on developing disruptive means to remodel and optimize the porcine gut microbiome and to evolve and enrich specific taxa that are affiliated with reduced AMR impacts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,965
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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