Virulence characterization of international collections of the wheat stripe rust pathogen, Puccinia striiformis f. sp. tritici
Notice bibliographique
Résumé
Wheat stripe rust (yellow rust [Yr]), caused by Puccinia striiformis f. sp. \ntritici, is an economically important disease of wheat worldwide. Virulence \ninformation on P. striiformis f. sp. tritici populations is important to \nimplement effective disease control with resistant cultivars. In total, 235 P. \nstriiformis f. sp. tritici isolates from Algeria, Australia, Canada, Chile, \nChina, Hungary, Kenya, Nepal, Pakistan, Russia, Spain, Turkey, and Uzbekistan \nwere tested on 20 single Yr-gene lines and the 20 wheat genotypes \nthat are used to differentiate P. striiformis f. sp. tritici races in the United \nStates. The 235 isolates were identified as 129 virulence patterns on the \nsingle-gene lines and 169 virulence patterns on the U.S. differentials. \nVirulences to YrA, Yr2, Yr6, Yr7, Yr8, Yr9, Yr17, Yr25, YrUkn, Yr28, Yr31, \nYrExp2, Lemhi (Yr21), Paha (YrPa1, YrPa2, YrPa3), Druchamp (Yr3a, \nYrD, YrDru), Produra (YrPr1, YrPr2), Stephens (Yr3a, YrS, YrSte), Lee \n(Yr7, Yr22, Yr23), Fielder (Yr6, Yr20), Tyee (YrTye), Tres (YrTr1, YrTr2), \nExpress (YrExp1, YrExp2), Clement (Yr9, YrCle), and Compair (Yr8, Yr19) \nwere detected in all countries. At least 80% of the isolates were virulent on \nYrA, Yr2, Yr6, Yr7, Yr8, Yr17, YrUkn, Yr31, YrExp2, Yr21, Stephens (Yr3a, \nYrS, YrSte), Lee (Yr7, Yr22, Yr23), and Fielder (Yr6, Yr20). Virulences to Yr1, Yr9, Yr25, Yr27, Yr28, Heines VII (Yr2, YrHVII), Paha (YrPa1, YrPa2, \nYrPa3), Druchamp (Yr3a, YrD, YrDru), Produra (YrPr1, YrPr2), Yamhill \n(Yr2, Yr4a, YrYam), Tyee (YrTye), Tres (YrTr1, YrTr2), Hyak (Yr17, YrTye), \nExpress (YrExp1, YrExp2), Clement (Yr9, YrCle), and Compair (Yr8, Yr19) \nwere moderately frequent (>20 to <80%). Virulence to Yr10, Yr24, Yr32, \nYrSP, and Moro (Yr10, YrMor) was low (≤20%). Virulence to Moro was \nabsent in Algeria, Australia, Canada, Kenya, Russia, Spain, Turkey, and \nChina, but 5% of the Chinese isolates were virulent to Yr10. None of the \nisolates from Algeria, Canada, China, Kenya, Russia, and Spain was \nvirulent to Yr24; none of the isolates from Algeria, Australia, Canada, \nNepal, Russia, and Spain was virulent to Yr32; none of the isolates from Australia, \nCanada, Chile, Hungary, Kenya, Kenya, Nepal, Pakistan, Russia, and \nSpain was virulent to YrSP; and none of the isolates from any country was \nvirulent to Yr5 and Yr15. Although the frequencies of virulence factors \nwere different, most of the P. striiformis f. sp. tritici isolates from these countries \nshared common virulence factors. The virulences and their frequencies \nand distributions should be useful in breeding stripe-rust-resistant wheat \ncultivars and understanding the pathogen migration and evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».