First Report of Cactodera estonica in Canada
Notice bibliographique
Résumé
A population of cyst nematode with terminal protuberance was found in soil samples associated with and on the roots of Polygonum aviculare L. at N45°23.480′, W75°40.463′ in South Ottawa, Ontario. Both J2 and cysts were found. It was subsequently confirmed with morphological and molecular methods as Cactodera estonica Krall and Krall, 1978 (Krall and Krall, 1978). The cysts are dark brown, elongated with length/breadth ratio more than 2, and vulval fenestra circumfenestrate 33 ± 4.1 (20–48) µm in diameter. Vulval slit is short 16 ± 2.7 (13–20) µm. Not all cysts have bullae or underbridge, when present a few bullae scattered on the ventral side of the cyst wall and the underbridge is thin; vulval denticles were found in one specimen. Male not found. J2 measurements are body length at 505 ± 45 (420–630) µm, stylet 25 ± 4.4 (22–29) µm long, and tail 36 ± 3.1 (34–38) µm with a short hyaline portion 14 ± 3.0 (12–19) µm. Lateral fields with four incisures. Tail end is round. All of these are consistent with those of C. estonica, for which the elongated cyst and short hyaline in J2 are characteristic for the species. Ribosomal DNA of the ITS, 18S, and D2/D3 of 28S regions were PCR amplified from cysts and J2s using primers 18S (5′-TTGATTACGTCCCTGCCCTTT-3′) and 26S (5′-TTTCACTCGCCGTTACTAAGG-3′) (Vrain et al., 1992), D2A (5′-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGT-3′) (Nunn, 1992) and D3B (5′-GACCCGTCTTGAAACACGGA-3′) (De Ley et al., 1999), and sequenced. The sequences of the ITS and D2/D3 regions of 1,480 and 1,363 bps, respectively, were deposited in Genbank with accession numbers MF774482 and MF774483. When blasted in to the NCBI database (August 2017), the ITS sequence was 99% similar to sequences of AF274417, a population of C. estonica from Belgium and of KX579922 from Turkey, and the D2/D3 sequence was 99% similar to sequences of HM560797 and HM560796, populations of C. estonica from China. This is the first reported case of this nematode species in Canada and the second for the western hemisphere (Norgren and Golden, 1986).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».