Comparative genetic analysis of Crocanthemum canadense (L.) Michx. plants of known pedigree (Chasmogamous- or cleistogamous-derived seeds) using amplified fragment length polymorphisms.
Notice bibliographique
Résumé
Crocanthemum canadense(L.) Michx., commonly known as Rockrose, is an endangered plant native to northeastern North America. Rockrose has a dual breeding system producing two types of flowers in different locations on the same plant in the same growing season: chasmogamous (cross-fertilizing) flowers and cleistogamous (self-fertilizing) flowers. Yorke et al. (2011) showed Nova Scotia populations of Rockrose had the lowest genetic variation of those examined in its northeastern limit. These results left the question of whether an underlying reason exists beyond disjunction, such as reproductive influences, for the reduced genetic variation in Nova Scotia. Additionally, several new populations were discovered in Annapolis Valley along Highway 201 and on the Greenwood Air Force Base. Amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) were used to measure and compare genetic diversity of plants of known pedigree and individuals belonging to newly discovered populations. Data were examined with analysis of molecular variance (AMOVA), principal coordinate analysis (PCoA), and a neighbour-joining tree to illustrate relationships among individuals and populations. It was determined no significant genetic variance existed between plants raised from cleistogamous or chasmogamous seeds. Very little genetic diversity was found between new populations examined, and a comparison against old populations also revealed very little genetic variation. Low population variance is likely due to continual inbreeding and low rates of cross-fertilization due to isolated, small populationspresent in Nova Scotia. Implications from this research may inform future conservation decisions. Potential breeding projects can use seeds produced by either cleistogamous or chasmogamous flowers without compromising the genetic integrity of Nova Scotia populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».