Enregistrement W7083317230 · doi:10.5281/zenodo.17202081

Table 2 in Ray spider rush: Fast-tracking integrative taxonomy in Panama's cloud forests

2025· dataset· en· W7083317230 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2025

Typedataset

Langueen

DomaineComputer Science

ThématiqueGeochemistry and Geologic Mapping

Établissements canadiensnon disponible

Organismes subventionnairesnon disponible

Mots-clésGenBankIdentification (biology)DNA barcodingTable (database)Taxonomy (biology)SpiderPhylogenetic tree

DOI10.5281/zenodo.17202081

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Table 2 (continued on next ten pages). List of the specimens used for the molecular phylogenetic analysis in the study, vouchers codes, DNA protocol, identification type (quantity), sex and localities. BIO=Biodiversity Intitute of Ontario; COPE=G.D. Omar Torrijos Herrera National Park; IMEDEA= Institut Mediterrani d’Estudis Avançats; PILA=La Amistad International Park; PNAC =Altos de Campana National Park; RFF=Forest Reserve Fortuna; CRBA=Centre de Recursos de Biodiversitat Animal. Numbers in parentheses=taxa quantity; Bold numbers =GMYC haplotypes (as in Fig. 2); Bold taxa=GenBank-only data. Voucher CodesBOLD Sequence ID / GenBank IDProtocolFamily / SubfamilyFast Identification (27)GMYC Cluster NumberIntegrative Identification (29)SexLocalitySCD1NDR015SPIPO354-10BIOMysmenidae (MYS, 1)Mysmena sp.1 FMLFCOPESFC1DBR021SPIPO006-10BIOAnapidae (ANA, 1)Anapis monteverdeAnapis monteverde Platnick & Shadab, 1978FRFFSFC1DAH006SPIPO778-10BIOSymphytognathidae (SYM, 1)Patu digua Forster & Platnick, 1977FRFF– / GU456915–Theridiosomatidae (THS, 246)15Coddingtonia euryopoides Miller, Griswold & Yin, 2009–– / HM030431–THS / Epeirotypinae (73)4Epeirotypus chavarria Coddington, 1986–SFC1N8H018SPIPA404-10BIOEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFC1NAR016epes1168 / PX096944CRBAEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFC1NCD018SPIPA400-10BIOEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFD1D8R010epes1120 / PX096942CRBAEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.MRFFSFD1DAR018epes1166 / PX096941CRBAEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFD1NBL015epes1058 / PX096940CRBAEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFD1NCD016SPIPA402-10BIOEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFU1N7H029SPIPA401-10BIOEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFU1NCD030epes1167 / PX096943CRBAEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.FRFFSFU2NCH029SPIPA403-10BIOEpeirotypus sp.1 FML5Epeirotypus kwakwa sp. nov.MRFFSAD1NFP007epes2176 / PX096956CRBAEpeirotypus sp.2 FML6Epeirotypus kote sp. nov.FPILASAU1NGA024epes2205 / PX096958CRBAEpeirotypus sp.2 FML6Epeirotypus kote sp. nov.MPILASAU1NGH021epes2204 / PX096957CRBAEpeirotypus sp.2 FML6Epeirotypus kote sp. nov.MPILASAU1NHA026epes2206 / PX096959CRBAEpeirotypus sp.2 FML6Epeirotypus kote sp. nov.FPILASFB1DAH019epes2183 / PX096947CRBAEpeirotypus sp.2 FML7Epeirotypus kra sp. nov.MRFFSFD1DAA016epes2184 / PX096948CRBAEpeirotypus sp.2 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFVoucher CodesBOLD Sequence ID / Protocol GenBank IDFamily / SubfamilyFast Identification (27)GMYC Cluster NumberIntegrative Identification (29)SexLocalitySFU1N8A024epes2203 / PX096949CRBAEpeirotypus sp.2 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU1NAA009epes2053 / PX096945CRBAEpeirotypus sp.2 FML7Epeirotypus kra sp. nov.MRFFSFU2NBD029epes2063 / PX096946CRBAEpeirotypus sp.2 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU1N7H026SPIPA391-10BIOEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU1N8L020epes3111 / PX096951CRBAEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.MRFFSFU1NBH019SPIPA390-10BIOEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU1NCA029epes3208 / PX096953CRBAEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU2NBA026epes3209 / PX096954CRBAEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU2NCH031epes3207 / PX096952CRBAEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSFU2NBH025epes4070 / PX096965CRBAEpeirotypus sp.4 FML9Epeirotypus tain sp. nov.FRFFSFD1DAL018epes5062 / PX096955CRBAEpeirotypus sp.5 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSTC1D5H013SPIPA395-10BIOEpeirotypus sp.6 FML3Epeirotypus jane sp. nov.FCOPESAC1DHH007SPIPA389-10BIOEpeirotypus sp.7 FML8Epeirotypus bule sp. nov.FPILASAU1NCL062SPIPA385-10BIOTheridiosoma sp.7 FML10Epeirotypus drune sp. nov.FPILASAC1DHH012epes7100 / PX096960CRBAEpeirotypus sp.7 FML10Epeirotypus drune sp. nov.FPILASAU1NCL035epes7240 / PX096962CRBAEpeirotypus sp.7 FML8Epeirotypus bule sp. nov.FPILASAU1NCR002SPIPA387-10BIOEpeirotypus sp.7 FML8Epeirotypus bule sp. nov.FPILASAU1NCR048epes7237 / PX096961CRBAEpeirotypus sp.7 FML10Epeirotypus drune sp. nov.FPILASAU2NCL028epes7239 / PX096964CRBAEpeirotypus sp.7 FML8Epeirotypus bule sp. nov.FPILASAU2NCL033epes7238 / PX096963CRBAEpeirotypus sp.7 FML8Epeirotypus bule sp. nov.FPILASFB1D9R032naafa191 / PX096968CRBANaatlo fauna11Naatlo fauna (Simon, 1897)FRFFSFB1DAR028naafa056 / PX096967CRBANaatlo fauna11Naatlo faunaMRFFSFB2D9R026SPIPA373-10BIONaatlo fauna11Naatlo faunaMRFFSFC1DBR019naafa118 / PX096966CRBANaatlo fauna11Naatlo faunaFRFFVoucher CodesBOLD Sequence ID / Protocol GenBank IDFamily / SubfamilyFast Identification (27)GMYC Cluster NumberIntegrative Identification (29)SexLocalitySFD1NBR033SPIPA374-10BIONaatlo fauna11Naatlo faunaFRFFSFU1N8A036SPIPA376-10BIONaatlo fauna11Naatlo faunaFRFFSFU1N8R028SPIPA375-10BIONaatlo fauna11Naatlo faunaFRFFSFU1NBR037naafa189 / PX096969CRBANaatlo fauna11Naatlo faunaMRFFSFU1NCD031SPIPA377-10BIONaatlo fauna11Naatlo faunaMRFFSFU1NCL016naafa190 / PX096970CRBANaatlo fauna11Naatlo faunaFRFFSCB1DFR042naas1187 / PX096980CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MPNACSCB1DGD011naas1192 / PX096977CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSCB1DIA010SPIPA371-10BIONaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSCC1NER014SPIPA370-10BIONaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSCC1NHD013SPIPA372-10BIONaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSCC2NFH008SPIPA369-10BIONaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSCU1NDH021naas1115 / PX096976CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MPNACSCU1NGH027naas1272 / PX096978CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MPNACSFB1D8L018SPIPA364-10BIONaatlo sp.1 FML14Naatlo chi sp. nov.FRFFSFB1D9H035naas1112 / PX096971CRBANaatlo sp.1 FML13Naatlo chi sp. nov.FRFFSFC1DAH012naas1271 / PX096972CRBANaatlo sp.1 FML13Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU1N7R038naas1273 / PX096974CRBANaatlo sp.1 FML14Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU1N8H023SPIPA366-10BIONaatlo sp.1 FML14Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU1NBR036SPIPA363-10BIONaatlo sp.1 FML13Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU1NCR036naas1269 / PX096975CRBANaatlo sp.1 FML14Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU1NCR045SPIPA367-10BIONaatlo sp.1 FML13Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU2NBH044naas1268 / PX096973CRBANaatlo sp.1 FML14Naatlo chi sp. nov.FRFFSFU2NCH028SPIPA365-10BIONaatlo sp.1 FML13Naatlo chi sp. nov.FRFFVoucher CodesBOLD Sequence ID / Protocol GenBank IDFamily / SubfamilyFast Identification (27)GMYC Cluster NumberIntegrative Identification (29)SexLocalitySTB1D9A009SPIPA368-10BIONaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MCOPESTB1D9R019naas1270 / PX096984CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MCOPESTC1D5A014naas1188 / PX096982CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.MCOPESTD1N7B029naas1186 / PX096981CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FCOPESTD1N7H025naas1266 / PX096983CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FCOPESTD1N7R022naas1267 / PX096985CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FCOPESCD1NFD017naas1185 / PX096979CRBANaatlo sp.1 FML12Naatlo chi sp. nov.FPNACSFU2NBH023epes3054 / PX096950CRBAEpeirotypus sp.3 FML7Epeirotypus kra sp. nov.FRFFSCD1DFR014SPIPA119-10BIOTHS / Ogulniinae (22)Ogulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCD1DFR031SPIPA120-10BIOOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCD1DHR010SPIPA361-10BIOOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCD1NGR012SPIPA362-10BIOOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.MPNACSAC1DDB013oguoc103 / PX097010CRBAOgulnius cf obtectus2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAU1NCB026oguoc196 / PX097012CRBAOgulnius cf obtectus2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAU2NCL030oguoc198 / PX097013CRBAOgulnius cf obtectus2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAU2NCL034oguoc194 / PX097011CRBAOgulnius cf obtectus2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASCD1DFH007oguoc195 / PX097019CRBAOgulnius cf obtectus1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCC1DER017ogus1119 / PX097021CRBAOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.MPNACSCD1DFD013SPIPA360-10BIOOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCD1DFR015ogus1110 / PX097020CRBAOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSCD1NER013oguoc193 / PX097018CRBAOgulnius sp.1 FML1Ogulnius zbodro sp. nov.FPNACSAB1DDA002SPIPA356-10BIOOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAB1DHL021ogus2197 / PX097015CRBAOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILASAC1DEH003ogus2199 / PX097009CRBAOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILASAD1NGL022ogus2200 / PX097016CRBAOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILAVoucher CodesBOLD Sequence ID / Protocol GenBank IDFamily / SubfamilyFast Identification (27)GMYC Cluster NumberIntegrative Identification (29)SexLocalitySAD1NHB024ogus2101 / PX097014CRBAOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAU1NCL037SPIPA359-10BIOOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILASAU1NDB035ogus2102 / PX097017CRBAOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILASAU1NDL029SPIPA355-10BIOOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.MPILASAU2NCA003SPIPA358-10BIOOgulnius sp.2 FML2Ogulnius debonaja sp. nov.FPILASAB1DEA003chts1248 / PX096992CRBATHS / Platoninae (22)Chthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.FPILASAB1DEL024SPIPA410-10BIOChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.MPILASAD1NGB019chts1247 / PX096996CRBAChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.MPILASAD1NGL021SPIPA411-10BIOChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.FPILASAD1NHH012chts1245 / PX096995CRBAChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.FPILASAU1NFB025chts1243 / PX096993CRBAChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.FPILASAU1NGA027chts1246 / PX096994CRBAChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.MPILASAU1NHB013SPIPA412-10BIOChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.FPILASAU1NHP003SPIPA413-10BIOChthonos sp.1 FML21Chthonos dobo sp. nov.MPILASFB1DAL021chts1123 / PX096990CRBAChthonos sp.1 FML19Chthonos dobo sp. nov.MRFFSFU1N7D015chts1059 / PX096989CRBAChthonos sp.1 FML19Chthonos dobo sp. nov.FRFFSFU1N7L018SPIPA409-10BIOChthonos sp.1 FML19Chthonos dobo sp. nov.MRFFSFU1NBD019chts1242 / PX096991CRBAChthonos sp.1 FML19Chthonos dobo sp. nov.MRFFSFU2NAA035chts1241 / PX096997CRBAChthonos sp.1 FML20Chthonos dobo sp. nov.FRFFSFU2NAD028chts1244 / PX096998CRBACh

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000

score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001

Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated

Catégories candidatesaucune

Catégories consensuellesaucune

DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune

Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet

GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données

Score de désaccord entre enseignants0,119

Score d'incertitude au seuil0,397

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,000	0,001
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,000	0,000
Méta-épidémiologie (sens large)	0,000	0,000
Bibliométrie	0,004	0,007
Études des sciences et des technologies	0,001	0,000
Communication savante	0,001	0,001
Science ouverte	0,001	0,001
Intégrité de la recherche	0,000	0,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,119	0,014

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031

Tête enseignante GPT0,245

Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail

Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Devis d'étudeSans objet

Domainenon disponible

GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0

Publié2025

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