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Enregistrement W7095117849

Supporting Information: The Substrate-Bound Crystal Structure of a Baeyer−Villiger Monooxygenase Exhibits a Criegee-like

2013· article· en· W7095117849 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubcloningPlasmidEcoRIDNACloning vectorPlasmid preparationDNA sequencingMolecular cloningRestriction enzymeInsert (composites)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Subcloning the chnB1 gene into the pJW234 expression vector The chnB1 gene was amplified using Pwo DNA polymerase (Roche) from the pSDRmchnB1 plasmid. 1 PCR primers with NsiI and EcoRI restriction sites were used to amplify the gene (restriction sites are underlined), as shown in Table S2. The desired band was purified using the QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen) and subcloned into the pPCR-Script Cam vector (Stratagene) using the PCR-Script Cam Cloning Kit (Stratagene). Plasmid DNA from positive clones was prepared using the QIAprep Spin MiniPrep kit (Qiagen), and then digested using NsiI and EcoRI (New England BioLabs). The pJW234 expression vector (obtained from Dr. Mirek Cygler, University Saskatchewan, Saskatoon, Canada) was digested with the same enzymes. The desired bands from both digests were purified using gel extraction (MO BIO Laboratories UltraClean 15 DNA Purification Kit). The chnB1 insert was ligated into the pJW234 vector, and this plasmid was used to transform E. coli DH5α cells. Plasmid DNA from positive clones was prepared using the QIAprep Spin MiniPrep kit (Qiagen), and DNA sequencing was used to confirm the sequence (McGill University and Genome Quebec Innovation Centre Sequencing Service, Montreal, Canada). The resultant plasmid is called His8-TEV-ChnB1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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