Supporting Information: The Substrate-Bound Crystal Structure of a Baeyer−Villiger Monooxygenase Exhibits a Criegee-like
Notice bibliographique
Résumé
Subcloning the chnB1 gene into the pJW234 expression vector The chnB1 gene was amplified using Pwo DNA polymerase (Roche) from the pSDRmchnB1 plasmid. 1 PCR primers with NsiI and EcoRI restriction sites were used to amplify the gene (restriction sites are underlined), as shown in Table S2. The desired band was purified using the QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen) and subcloned into the pPCR-Script Cam vector (Stratagene) using the PCR-Script Cam Cloning Kit (Stratagene). Plasmid DNA from positive clones was prepared using the QIAprep Spin MiniPrep kit (Qiagen), and then digested using NsiI and EcoRI (New England BioLabs). The pJW234 expression vector (obtained from Dr. Mirek Cygler, University Saskatchewan, Saskatoon, Canada) was digested with the same enzymes. The desired bands from both digests were purified using gel extraction (MO BIO Laboratories UltraClean 15 DNA Purification Kit). The chnB1 insert was ligated into the pJW234 vector, and this plasmid was used to transform E. coli DH5α cells. Plasmid DNA from positive clones was prepared using the QIAprep Spin MiniPrep kit (Qiagen), and DNA sequencing was used to confirm the sequence (McGill University and Genome Quebec Innovation Centre Sequencing Service, Montreal, Canada). The resultant plasmid is called His8-TEV-ChnB1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».