Evolution of IncA/C blaCMY-2-Carrying Plasmids by Acquisition of the
Notice bibliographique
Résumé
The blaNDM-1 gene has been reported to be often located on broad-host-range plasmids of the IncA/C type in clinical but also environmental bacteria recovered from the NewDelhi, India, area. IncA/C-type plasmids are the main vehicles for the spread of the cephalosporinase gene blaCMY-2, frequently identified in the United States, Canada, and Europe. In this study, we completed the sequence of IncA/C plasmid pNDM-KN carrying the blaNDM-1 gene, recovered from a Klebsiella pneumoniae isolate from Kenya. This sequence was compared with those of three IncA/C-type reference plasmids from Escherichia coli, Yersinia ruckeri, and Photobacterium damselae. Comparative analysis showed that the blaNDM-1 gene was located on a widely diffused plasmid scaffold known to be responsible for the spread of blaCMY-2-like genes and consequently for resistance to broad-spectrum cepha-losporins. Considering that IncA/C plasmids possess a broad host range, this scaffold might support a large-scale diffusion of the blaNDM-1 gene among Gram-negative rods. The blaNDM-1 genewas initially identified inKlebsiella pneumoniaeand Escherichia coli isolates but has since been reported formany different enterobacterial species and alsoAcinetobacter baumannii (7, 14–16, 19, 29, 32). Noteworthy, the blaNDM-1 gene was most often reported tobe carriedonplasmids in enterobacterial species,whereas it was chromosomally carried in A. baumannii (14). In particular, it has been often reported to be carried on IncA/C-type plasmids, as
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».