DOI:10.1111/j.1574-6968.2007.01045.x
Notice bibliographique
Résumé
antimicrobial resistance; Typhimurium; parallel evolution; public health; bacteria. The increase in frequency of Salmonella enterica resistant to antibiotics in food-producing animals is of great concern to public health. Determining the rate at which different resistance phenotypes are generated and maintained in the environment is thus of great importance. The distribution and evolution of antibiotic resistance and multidrug-resistance in 362 Salmonella stains as part of a cross-sectional study of the Canadian swine industry were investigated. The susceptibility of all isolates to 12 antimicrobial agents was tested and the statistical and phylogenetic distribution of resistance among strains characterized via multi-locus sequence typing was studied to test the origin of multidrug-resistance in Salmonella. More than 25 % of all isolates were multidrug-resistant, with pre-dominance in serotype Typhimurium, a serotype of vital importance to public health. The strong associations between resistance phenotypes, which differ among serotypes and which is supported by the significant genetic distance between serotypes, was indicative of the independent acquisition of multidrug-resistance in at least two different serotypes, i.e. Typhimurium and Derby. The independent origin of multidrug-resistance in Salmonella indicates that strong selective pressures are present in the environment of the bacteria and that statistical and phylogenetic studies of antibiotic resistance are an essential part in the under-standing and the control of the epidemic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,954 | 0,942 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».