DOI: 10.1126/science.1124513Supporting Online Material Materials and Methods Cloning
Notice bibliographique
Résumé
Based on H3 numbering (S1), cDNA corresponding to residues 11–329 (HA1) and 1–176 (HA2) of the ectodomain of the hemagglutinin (HA) from A/Vietnam/1203/2004 (Viet04; Accession No. AY651334 & AY818135) (S2), A/Duck Alberta/35/1976 (H1_Duck; Accession No. AF091309 & D10477) and A/Duck/Singapore/Q-F119-3/1997 (H5-Duck; Accession No. AF303057) was cloned into the baculovirus transfer vector, pAcGP67-A (BD Biosciences Pharmingen, San Jose, CA). In a similar fashion to the construct used for expression of the 1918 influenza virus HA for structural studies (S3), the construct also incorporated a C-terminal thrombin cleavage site, a "foldon " sequence (S4) and a hexa His-tag at the extreme C terminus of the construct to enable protein purification. Once sequence verified, the plasmid was used for mutation studies. Primers containing point mutations around the receptor-binding site (see Figure 1) were designed using the web based program, PrimerX
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,405 | 0,420 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».