1 Cell Host & Microbe, Volume 2 Supplemental Data Heparan Sulfate Proteoglycans Provide a Signal to Plasmodium Sporozoites to Stop Migrating and Productively Invade Host Cells
Notice bibliographique
Résumé
Isolation of mouse dermal fibroblasts (MDFs). 1 cm x 1 cm strips of skin from the back of a male Balb/C mouse were soaked in penicillin/streptomycin for 3 min before mincing into 1 mm x 1 mm pieces under sterile conditions. Skin pieces were then incubated in Liberase III (Roche Applied Sciences) for 1 hr at 37°C with agitation followed by grinding with PBS/0.2 % BSA and centrifugation for 10 min at 100 x g. The tissue was then filtered through 70 µm mesh, centrifuged, resuspended in DMEM/FCS and transferred to a 25-cm2 culture flask. Disaccharide Analysis. Cell lysates were treated overnight with 2 mg/ml Pronase followed by purification of the glycopeptides by anion exchange chromatography using DEAE Sephacel. Columns were washed with 0.25 M NaCl in 20 mM sodium acetate, pH 6.0 and eluted with 2 M NaCl. Glycans were released from peptides by β-elimination and repurified by anion exchange chromatography. Uronic acid concentration was determined by carbazole assay (Bitter and Muir, 1962) and HS composition was determined as follows: Chains were digested with heparin lyases I, II, and III (Ibex, Montreal, Canada), and the
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,380 | 0,199 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».