Spread of Virulent Group A Streptococcus Type emm59 from
Notice bibliographique
Résumé
Full-genome sequencing showed that a recently emerged and hypervirulent clone of group A Streptococ-cus type emm59\tactive\tin\tCanada\tand\tparts\tof\tthe\tUnited States has now caused severe invasive infections in ru-ral northeastern Wyoming. Phylogenetic analysis of ge-nome data indicated that the strain was likely introduced from Montana. Strains of group A Streptococcus (GAS) type emm59 historically have not been commonly associated with invasive infections. However, a striking increase in the fre-quency and severity of invasive infections caused by type emm59 strains recently occurred in Canada (1). Four of the authors (M.L.M., P.L.F., R.N., and M.M.) cared for 4 patients whose cases were temporally clus-tered and who had severe invasive infections caused by GAS in northeastern Wyoming, USA. Of the 4 case-patients, 2 were directly linked. Case-patient 4 contracted invasive infection from a close-contact family member (case-patient 2). Case-patient 3 was a physician who had cared for case-patients 1 and 2. These infections occurred in an area close to where a cluster of 6 invasive emm59 infections occurred in Montana in 2010 (2). This fact led us to determine whether genetically related emm59 strains were responsible. Full-genome sequencing confirmed this hypothesis (Figure).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».