Characteristics of NDM-1-producing Escherichia coli isolates that belong to the successful and virulent clone ST131,”Antimicrobial Agents and Chemotherapy
Notice bibliographique
Résumé
An NDM-1 carbapenemase-producing Escherichia coli isolate of sequence type 131 (ST131) that belonged to phylogenetic group B2 was obtained from a patient with a urinary tract infection who returned to the United States after a recent hospitalization while visiting India. NDM-1-producing E. coli ST131 had significantly more virulence factors than NDM-1-producing E. coli ST101, previously isolated from a patient in Canada. The presence of NDM -lactamases in a very successful and virulent E. coli sequence type is of concern. The development of resistance to the carbapenems in the Enterobacteriaceae is a major issue, since these agents are often the last line of effective therapy available for the treatment of infections caused by these bacteria (13). There are 3 types of -lactamases that inactivate the carbapenems (also called car-bapenemases): the KPC types, the metallo--lactamases (MBLs), and the oxacillinases (13). The 2 most common types of MBL found in Enterobacteriaceae are the VIM and IMP types (7). Recently, a new type of MBL, named NDM-1, has been described in bacteria (Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli) recovered from a Swedish patient who was hospitalized in New Delhi, India (24). Kumarasamy and colleagues (11) pro-vided evidence that NDM-producing Enterobacteriaceae (mostly K. pneumoniae and E. coli) are widespread in India, Pakistan, and the United Kingdom. NDM-producing Entero-bacteriaceae have also recently been isolated from patients residing in the United States (1), the Netherlands (12), Aus-
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».