Étude des hôtes réservoirs de l'anaplasmose granulocytaire dans un environnement péri-domestique du sud du Québec
Notice bibliographique
Résumé
L’anaplasmose granulocytaire humaine (AGH) est une maladie vectorielle causée par la bactérie Anaplasma phagocytophilum (Ap) et transmise par la tique Ixodes scapularis. Le variant zoonotique, dit « human active » (Ap-ha), est pathogène pour l’humain, le cheval et le chien. L’AGH est en émergence au Canada et au Québec, où un agrégat inhabituel de cas a été détecté en 2021 dans la région de l’Estrie, au sud du Québec. L’objectif de ce mémoire est de mieux comprendre quelles espèces de micromammifères sauvages peuvent être considérées comme des hôtes réservoirs compétents du variant Ap-ha, ce qui est pour le moment inconnu dans le contexte canadien. Au cours des étés 2022 et 2023, 547 micromammifères ont été capturés sur huit sites boisés péri-domestiques de la région de Bromont afin d’évaluer le niveau d’infestation par des tiques immatures, leur statut infectieux pour Ap-ha et leur capacité à infecter des larves. Nos résultats nous permettent d’affirmer que le tamia rayé (Tamias striatus) et la souris du genre Peromyscus (Peromyscus spp.) constituent des réservoirs compétents d’Ap-ha dans le sud du Québec. Il s’agit de la première étude canadienne à s’intéresser aux hôtes réservoirs de l’AGH et à détecter ce pathogène chez des espèces autres que la souris à pattes blanches au Canada. Ce projet s’inscrit dans une approche Une Seule Santé puisqu’il intègre des notions d’écologie et d’épidémiologie afin de mieux comprendre l’émergence de l’AGH et d’orienter le développement d’interventions de gestion du risque en santé humaine et animale.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».