L’effet protecteur de la consommation d'alcool sur le risque de diabète de type 2 : une étude pan-génomique
Notice bibliographique
Résumé
La relation entre la consommation d’alcool et le risque de diabète de type 2 est décrite dans la littérature comme une relation en U ou en J, c’est-à-dire que le risque de diabète de type 2 est plus faible chez les consommateurs modérés, lorsque comparé aux les consommateurs excessifs ou aux non consommateurs d’alcool. De plus, la relation entre la consommation d’alcool et le risque de diabète de type 2 diffère entre les sexes, l’effet de protection est plus présent chez les femmes que chez les hommes, ce qui suggère la possible présence d’une interaction entre des facteurs sexo-spécifiques et le métabolisme de l’alcool. Dans cette étude, nous avons réalisé une étude d’association pangénomique pour identifier des variants génétiques qui modifient la relation entre la consommation d’alcool et le risque de diabète de type 2 de manière sexo-spécifique. Nous avons utilisé la UK Biobank dans une approche cas-témoins qui incluait 309 568 participants pour réaliser une étude de l’interaction triple entre la consommation d’alcool, les variants génétiques et le sexe des individus et leur effet sur le risque de diabète de type 2. Nous avons identifié un variant rs78681203, localisé entre les gènes EDN2 et FOXO6, avec une interaction sexo-spécifique avec la consommation d’alcool (valeur p d’interaction = 2,85 x 10-8). L’allèle T de risque du SNP rs78681203 était associée avec une augmentation du risque de diabète de type 2 chez les femmes qui consommaient 0-4 unités britanniques/semaine d’alcool (OR = 1,19, 95 % IC : 1,07-1,34) mais avait un effet protecteur chez les femmes qui consommaient de 4-28 unités britanniques/semaine (OR = 0,81, 95 % IC : 0,69-0,95). À l’inverse, chez les hommes qui consommaient entre 0-4 unités britanniques/semaine d’alcool le variant génétique avait un effet protecteur contre le diabète de type 2 (OR = 0,85, 95 % IC : 0,74-0,99) et il y avait une augmentation du risque de diabète de type 2 chez les hommes qui consommaient entre 4-28 unités britanniques/semaine (OR = 1,19, 95 % IC : 1,08-1,32). Ces résultats indiquent que les variants génétiques jouent un rôle dans les effets différentiels de protection de l’alcool contre le risque de diabète de type 2 entre les sexes. Des études de réplication et de compréhension des mécanismes derrière ce variant sont nécessaire pour clarifier le rôle de ce celui-ci.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».