Systematic Review and Meta-analysis of Pharmacogenetic Allele and Genotype Frequencies in the Vietnamese Population Compared With Global Populations
Notice bibliographique
Résumé
Background: Genetic variability plays a crucial role in drug metabolism, treatment response, and the risk of adverse drug reactions. Allele frequencies of pharmacogenetically relevant genes such as CYP2C19, CYP2D6, CYP2C9, CYP3A5, NAT2, SLCO1B1, UGT1A1, and ABCB1 vary significantly across populations. In Vietnam, existing studies remain scattered and limited in sample size, lacking a comprehensive synthesis. A systematic comparison between the Vietnamese population and major global populations is essential for precision medicine and rational drug policy development. Objectives: (1) To systematically collect and estimate allele and genotype frequencies of pharmacogenetically relevant genes in the Vietnamese population. (2) To compare allele/genotype distributions between Vietnamese and major global populations, including East Asian, South Asian, European, African, and Admixed American populations. (3) To generate pooled estimates and genetic distribution maps informing personalized medicine and drug regulatory policies. Methods: A systematic search will be conducted across PubMed, Embase, Scopus, Web of Science, Google Scholar, and Vietnamese national journals. Additional population data will be retrieved from the 1000 Genomes Project, gnomAD, and ALFA databases. Eligible study designs include cross-sectional, cohort, population genetic, and clinical studies reporting allele or genotype frequencies. Data extraction will include SNP identifiers, genotype counts (AA, Aa, aa), allele frequency, sample size, ethnic subgroup, and genotyping methods. Risk of bias will be assessed using a modified Newcastle–Ottawa Scale appropriate for genetic epidemiology. Meta-analysis of proportions will be performed using random-effects models (Freeman–Tukey transformation). Subgroup analyses will be stratified by gene, ethnic group (Kinh vs. minorities), and genomic dataset. Heterogeneity will be evaluated using I² and Q statistics. Expected Outcomes: This review will provide pooled allele and genotype frequencies for major pharmacogenes in Vietnam and comparative data across global populations. The findings will support clinical pharmacogenetics implementation, personalized dosing strategies, and national drug regulation policies. Registration Purpose: This protocol is preregistered on OSF to ensure transparency, prevent selective reporting, and strengthen methodological rigor prior to conducting data extraction and meta-analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,040 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,017 | 0,026 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».