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Enregistrement W7116748815 · doi:10.1111/his.70075

<scp> <i>GREB1</i> </scp> ‐rearranged uterine tumour shares a common <scp>DNA</scp> methylation signature with <scp> <i>ESR1</i> </scp> ‐rearranged <scp>UTROSCT</scp>

2025· article· en· W7116748815 sur OpenAlexaff
Cheng‐Han Lee, Yow‐Shan Lee, Jennifer A. Bennett, David L. Kolin, Jen‐Chieh Lee, Hsuan‐Ying Huang, Martin Köbel, Mark Sementsov, Brendan C. Dickson, Christian Koelsche, Friedrich Kommoss, Andreas von Deimling, Felix K F Kommoss

Notice bibliographique

RevueHistopathology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensSinai Health SystemUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryMethylationDNA methylationSignature (topology)Uterus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: GREB1-rearranged uterine tumours encompass a group of uterine mesenchymal tumours with varied histologic appearances. The fusion partners to GREB1 include NCOA1-3, SS18 and NR4A3. Given that some GREB1-rearranged uterine tumours exhibit histologic features of uterine tumours resembling ovarian sex cord tumour (UTROSCT), there is a general belief that GREB1-rearranged uterine mesenchymal tumours are part of the UTROSCT family. METHODS: In this study, we applied global DNA methylation and copy number analyses to a series of 10 GREB1-rearranged uterine tumours and 21 classic UTROSCTs (7 of which were molecularly confirmed to harbour ESR1::NCOA2/3 fusions). RESULTS: We found that GREB1-rearranged uterine tumors show an overlap in their global methylation profiles with UTROSCT, including ESR1::NCOA2/3 positive cases. Together, these tumours form a DNA methylation cluster separate from uterine smooth muscle tumours (leiomyomas and leiomyosarcomas), endometrial stromal sarcomas (low-grade and high-grade), embryonal rhabdomyosarcoma and SMARCA4-deficient uterine sarcomas. However, despite their epigenetic similarity, there were two notable differences. First, GREB1-rearranged uterine tumours as a group displayed a greater degree of genomic complexity with more extensive copy number alterations than conventional UTROSCTs, including those harbouring ESR1::NCOA2/3. Second, GREB1-rearranged uterine tumours frequently lacked overt sex cord morphology: while all 7 ESR1::NCOA2/3 UTROSCTs demonstrated corded, nested, trabecular and/or tubular/sertoliform patterns, only 1 GREB1-rearranged uterine tumour displayed a prominent trabecular pattern, with the remaining cases showing exclusively or predominantly diffuse/solid growth. CONCLUSIONS: Overall, our findings confirm that GREB1-rearranged uterine tumours are part of the UTROSCT spectrum, though they frequently exhibit a more diffuse growth pattern and a higher degree of genomic instability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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