CRISPR/Cas9 Knockout Studies Implicate Phenazine-1-carboxylic Acid, but Not 2-Hydroxy Phenazine, in the Biocontrol Activity of Pseudomonas chlororaphis Subsp. phenazini Strain S1Bt23 Against Pythium arrhenomanes (Drechsler)
Notice bibliographique
Résumé
Liquid chromatography–mass spectrometry analysis of Pseudomonas chlororaphis subsp. phenazini S1Bt23 extracts detected phenazine-1-carboxylic acid (PCA) and 2-hydroxyphenazine (2-OH-PHZ) as the main phenazine derivatives. We investigated their relative contributions to the antagonistic activity of strain S1Bt23 against Pythium arrhenomanes, a root rot pathogen of corn. CRISPR-Cas9 knockouts were carried out on the phzF gene, required for PCA synthesis, and the phzO gene, which is involved in converting PCA to 2-OH-PHZ. Deletion of the phzF gene abrogated the production of PCA and 2-OH-PHZ, and the ΔphzF mutant lost the antagonism against Pythium arrhenomanes. In contrast, deletion of the phzO gene created a 2-OH-PHZ-negative mutant with intact antagonistic ability. Concordantly, S1Bt23 wild type and the ΔphzO mutant, but not the ΔphzF mutant, significantly bioprotected corn seeds of a susceptible inbred variety, CO441, from P. arrhenomanes. At equimolar amounts of 75 nM, synthetic PCA inhibited Pythium growth, whereas 2-OH-PHZ did not. This highlights the critical contribution of PCA to the biocontrol activity of strain S1Bt23 against P. arrhenomanes. Unexpectedly, deletion of phzO did not result in additional PCA accumulation. This suggests that the conversion of PCA to 2-OH-PHZ by S1Bt23 is a potential protective mechanism against the overproduction of lethal cellular doses. This study paves the way for bioengineering strain S1Bt23 into a more effective biopesticide.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».