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Enregistrement W7116883566 · doi:10.1038/s41592-025-02965-z

Glutamate indicators with increased sensitivity and tailored deactivation rates

2025· article· en· W7116883566 sur OpenAlexaff
Abhi Aggarwal, Adrian Negrean, Yang Chen, Rishyashring R. Iyer, Daniel Reep, Anyi Liu, Anirudh Palutla, Michael E. Xie, Bryan MacLennan, Kenta M. Hagihara, Lucas W. Kinsey, Julianna L. Sun, Pantong Yao, Arthur Tsang, Getahun Tsegaye, Yonghai Zhang, Ronak Patel, Benjamin J. Arthur, Julien Hiblot, Philipp Leippe, Mirosław Tarnawski, Jonathan S. Marvin, Jason Vevea, Srinivas C. Turaga, Alison G. Tebo, Matteo Carandini, L. Federico Rossi, David Kleinfeld, Arthur Konnerth, Karel Svoboda, Glenn Turner, Jeremy P. Hasseman, Kaspar Podgorski

Notice bibliographique

RevueNature Methods · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilBoehringer Ingelheim StiftungNational Institutes of HealthHuman Frontier Science ProgramDeutsche ForschungsgemeinschaftUK Research and InnovationAmerican Lebanese Syrian Associated CharitiesGiovanni Armenise-Harvard FoundationPaul and Daisy Soros Fellowships for New AmericansHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésGlutamate receptorNeurotransmissionSensitivity (control systems)Hippocampal formationNeural activityFluorescenceInformation transmission

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding how neurons integrate signals from thousands of input synapses requires methods to monitor neurotransmission across many sites simultaneously. The fluorescent protein glutamate indicator iGluSnFR enables visualization of synaptic signaling, but the sensitivity, scale and speed of such measurements are limited by existing variants. Here we developed two highly sensitive fourth-generation iGluSnFR variants with fast activation and tailored deactivation rates: iGluSnFR4f for tracking rapid dynamics, and iGluSnFR4s for recording from large populations of synapses. These indicators detect glutamate with high spatial specificity and single-vesicle sensitivity in vivo. We used them to record natural patterns of synaptic transmission across multiple experimental contexts in mice, including two-photon imaging in cortical layers 1-4 and hippocampal CA1, and photometry in the midbrain. The iGluSnFR4 variants extend the speed, sensitivity and scalability of glutamate imaging, enabling direct observation of information flow through neural networks in the intact brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,406 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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