Zinc-Finger 5 Is an Activation Domain in the Saccharomyces cerevisiae Stress-Responsive Transcription Factor Fzf1
Notice bibliographique
Résumé
Fzf1 is a Saccharomyces cerevisiae transcription factor that contains five zinc finger domains (ZF1-5) and induces the expression of at least five genes in response to various chemical stresses by recognizing the shared promoter consensus sequence CS2. The N-terminal ZF1-3 are required and sufficient for binding to CS2, while ZF4 negatively regulates the activity of Fzf1. However, the effect of ZF5 on the activity of Fzf1 is not well defined. In this study, substitutions of the two zinc-coordinating Cys residues (C248S and C253S) of ZF5, or deletion of the whole ZF5 domain, compromised the chemical stress-induced activation of Fzf1. Since the elevated Fzf1-regulated gene expression caused by fzf1-ZF4 could also be reversed by additional deletion of ZF5 or C248S/C253S substitutions, fzf1-ZF5 mutations are epistatic over fzf1-ZF4 mutations. Furthermore, fzf1-ZF5 mutations are recessive to FZF1, while ZF5 is dispensable for the CS2 binding. Finally, Fzf1-ZF5 is required and sufficient to serve as a transcription activation domain when fused to a Gal4 DNA-binding domain. These observations collectively support a working model in which Fzf1 bound to its target gene promoters remains inactive due to an inhibitory activity of ZF4. Upon chemical stress, ZF4 is no longer able to inhibit the ZF5 transactivation activity, leading to the induction of Fzf1-regulated gene expression and subsequent chemical detoxification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».