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Enregistrement W7117369926 · doi:10.1016/j.ijid.2025.108348

Evidence on mpox clade Ia and clade Ib: A rapid research needs appraisal

2025· article· en· W7117369926 sur OpenAlexfundno aff
Dijana Spasenoska, Naemi Araya, Marieke de Swart, Nicholas Henschke, Eli P Harriss, Greta Tam, Amen Patrick-Nwosu, Marakiya T. Moetlediwa, Musawenkosi Ndlovu, Yonela Ntamo, Katrin Probyn, Salome Steinke, Lauren Ashley, Vincent Chi‐Chung Cheng, Gemma Villanueva, Tamsyn Harris, Duduzile Ndwandwe, Lance Turtle, Serena Carville, Alice Norton

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean CommissionNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitNational Institute for Health and Care ResearchGovernment of the United KingdomInternational Development Research CentreEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipWellcome Trust
Mots-clésCladeCritical appraisalPublic healthBaseline (sea)Basic research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The emergence of a new mpox sub-clade Ib and changes in transmission pattern are of concern. To inform strategies to protect populations and improve outcomes, we implemented a rapid research needs appraisal (RRNA) to identify existing evidence on mpox clade I. METHODS: We searched Embase, MEDLINE, Scopus, and grey literature to 11 February 2025 for human mpox clade I studies. RESULTS: Of 79 studies identified, 2.5% (2/79) were interventional, 97.4% (77/79) observational, presenting data on 59,183 mpox cases. Most (57/79) focused on clade Ia, 16/79 clade Ib, and 6/79 unspecified sub-clade I. 90.8% were set in Africa. Studies focused on clinical characteristics (n = 55), transmission (n = 23), risk factors for disease/severe disease (n = 13), diagnostics (n = 9), social/behavioural factors (n = 6), immune response/seroprevalence (n = 5), and vaccine/treatments (n = 4). Symptoms and complications were similar for both sub-clades. Three studies reported foetal death in 8/12-8/14 pregnant women infected with clade Ib and in 3/4 of women with clade Ia. The pooled case fatality rate (CFR) was 6% (95% CI 3% to 8%) in clade Ia studies and 1% (95% CI 0% to 1%) in clade Ib studies. There were no studies on effectiveness of prevention, treatment, risk of asymptomatic infection, or immune protection over time. CONCLUSION: The identified evidence-gaps provide a baseline to inform coordinated research strategies to generate evidence for clinical and public health responses to improve outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,163
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,355
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,163
Score d'incertitude au seuil0,862

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1630,355
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,016
Bibliométrie0,0420,021
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0130,016
Science ouverte0,0060,009
Intégrité de la recherche0,0090,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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