Emerging Forms of Avian Orthoreovirus Infection in Turkeys in Québec, Canada, Associated with Tenosynovitis, Hepatitis, and Encephalitis (2020–2022)
Notice bibliographique
Résumé
Formas Emergentes de infección por Orthoreovirus aviares en pavos en Quebec, Canadá, asociadas con tenosinovitis, hepatitis y encefalitis (entre los años 2020-2022). Desde el año 2011, han surgido nuevas cepas de orthoreovirus aviar en pavos comerciales en Norteamérica, caracterizadas principalmente por tenosinovitis y, en raras ocasiones, por hepatitis necrosante en aves jóvenes. En el año 2020, se diagnosticaron infecciones por orthoreovirus en parvadas de pavos por primera vez en Quebec, lo que ocasionó importantes pérdidas económicas tanto en pavipollos jóvenes como en pavos mayores. En la necropsia, las aves mayores presentaron tenosinovitis linfoplasmocítica, ocasionalmente asociada con rotura aórtica. En los pavipollos jóvenes, las lesiones se caracterizaron principalmente por focos necróticos hepatocelulares y hepatocitos sincitiales degenerados. Algunos pavipollos de 31 y 69 días de edad presentaron ataxia y temblores, además de una encefalitis no supurativa que afectó al cerebelo y la protuberancia anular. Un nuevo protocolo de inmunohistoquímica demostró con éxito la presencia del virus en las lesiones pulmonares, hepáticas y esplénicas de aves con hepatitis. Estos pavitos con hepatitis presentaron la carga viral más alta (valor de ciclo umbral [Ct] promedio mediante PCR cuantitativa con transcriptasa inversa [RT-qPCR] de 11.56 ± 2.16) en comparación con los casos de tenosinovitis (23.54 ± 3.77) y encefalitis (22.4 y 33.1; P < 0.0001). Se obtuvieron secuencias completas del genoma (WGS) de todos los segmentos del ARN reoviral (n = 10) de 14 aislados de ortoreovirus del pavo, incluyendo un aislado vinculado a encefalitis. En general, se identificaron al menos cuatro cepas diferentes según su perfil de reordenamiento (PR), lo que ilustra la alta variabilidad genómica del virus. Sin embargo, ningún perfil de reordenamiento pudo asociarse con un patotipo viral específico. En conclusión, diferentes cepas de ortoreovirus aviar se están propagando en las parvadas de pavos de Norteamérica, asociadas con múltiples síndromes patológicos, como tenosinovitis, hepatitis y encefalitis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».