Mapping molecular pathways underlying the relationship between plasma ptau and Alzheimer's disease pathology: an imaging‐transcriptomic study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Collective evidence suggests that plasma ptau181 and 217 reflect Alzheimer's disease (AD) from the amyloid‐beta (Aβ) to tau pathologies. However, possible molecular pathways underlying the biological mechanisms that relate AD pathology with plasma ptau have not yet been elucidated. Method We studied 549 participants from two cohorts: ADNI (Aβ‐: 83 CN; Aβ+: 171 CN, 97MCI, 39 AD; Aβ‐PET: [ 18 F]AV45; tau‐PET: [ 18 F]AV1451) and TRIAD (Aβ‐: 26 Young, 62 CN; Aβ+: 29 CN, 30 MCI, 24 AD; Aβ‐PET: [ 18 F]AZD4694; tau‐PET: [ 18 F]MK6240). Both cohorts included plasma ptau181 and 217, which were quantified using the SIMOA/Janssen. All images were processed using Freesurfer or PETsurfer into the DKT atlas. Linear regression models investigated the associations between plasma ptau and Aβ‐PET or tau‐PET, adjusted for age, sex, education, and APOEε4. Partial least squares (PLS) analysis identified a set of transcriptomic profiles from the Allen Human Brain Atlas (AHBA) associated with the ptau181‐PET (Aβ and tau‐PET) or ptau217‐PET relationships. Then, gene set enrichment analyses based on GO and KEGG databases and STRINGdb protein‐protein interactions were conducted to highlight which molecular/biological processes and cellular components are associated with the identified transcriptomic profiles. Result The ptau181‐PET and ptau217‐PET relationships were significantly associated with the spatial distribution of the AHBA, explaining >90% and >82% in variance in the 1st PLS component from both cohorts, respectively (Figure 1). Subsequent gene enrichment analyses showed mitochondrial metabolism for ptau181‐PET and synaptic function for ptau217‐PET as converging GO AD‐Biodomains (Figure 2). The KEGG enrichment analyses identified pathways of neurodegeneration for ptau181‐PET and cytokine‐cytokine receptor interaction for ptau217‐PET as converging annotations (Figure 2). Notably, TRIAD also showed Alzheimer's disease KEGG annotation from both ptau models (Figure 2). The STRINGdb analyses confirmed significant protein‐protein interactions and revealed MAPT, PINK1, and SNCA proteins with the largest betweenness metric within significant networks of KEGG terms from TRIAD, while BCL2L1, PINK1, and GSK3β proteins were identified in ADNI (Figure 3). Conclusion Imaging‐transcriptomic analyses showed unique sets of transcriptomic profiles, highlighting mitochondrial metabolism and synaptic as key AD‐biodomains underlying the plasma ptau‐AD pathology relationship. Our study underscores the MAPT and SNCA proteins and intracellular signalling as salient molecular pathways in neurodegeneration and AD dementia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».