Molecular study of the interaction between Clostridioides difficile bacteriophages and their host receptor, the surface protein SlpA
Notice bibliographique
Résumé
L’émergence de souches bactériennes hypervirulentes de Clostridioides difficile, principale cause d’infections nosocomiales dans les pays industrialisés, souligne l’urgence de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques. Parmi celles-ci, la phagothérapie, reposant sur l’utilisation de bactériophages ciblant spécifiquement les bactéries, suscite un regain d’intérêt. Toutefois, son application chez C. difficile demeure limitée par notre compréhension incomplète des mécanismes moléculaires impliqués dans la reconnaissance de l’hôte par les phages. Ce travail de thèse vise à élucider les bases moléculaires de l’interaction entre les phages infectant C. difficile et leur récepteur bactérien, la protéine de surface SlpA (Surface Layer Protein A), composant majeur de la couche S. Dans une première étude, à l’aide de la souche épidémique R20291 et de son dérivé FM2.5, un mutant naturel n’exprimant pas slpA, nous avons montré que l’absence de SlpA confère une résistance complète à plusieurs phages, et que cette sensibilité peut être restaurée par la réintroduction de slpA via un plasmide. De plus, la complémentation de FM2.5 avec 12 isoformes différentes de slpA a révélé une spécificité d’interaction entre les isoformes et les phages testés. Dans le second volet, nous avons décidé d’identifier les régions du récepteur importantes pour la reconnaissance par les phages. Cette protéine est clivée en deux fragments: une sous-unité de haut poids moléculaire (HMW) ancrée à la surface cellulaire et une sous-unité de faible poids moléculaire (LMW) exposée à l’extérieur, divisé en deux domaines, D1 et D2. Nous avons généré des mutants ciblés, incluant des délétions complètes et partielles du domaine D2, des constructions chimériques entre isoformes, et des variants exprimant uniquement le fragment de HMW. L’étude des profils d’infection et d’adsorption a mis en évidence un rôle déterminant du domaine D2 dans la reconnaissance par certains phages. Les chimères ont montré que l’interaction nécessite généralement la combinaison isoforme-spécifique des deux fragments, suggérant une reconnaissance reposant sur des déterminants structuraux propres à chaque isoforme. Ces travaux améliorent la compréhension des interactions phages–SlpA de C. difficile et, plus largement, des interactions phage–couche S. Ils ouvrent la voie à la conception de cocktails à large spectre et de phages recombinants ciblant des souches réfractaires, pour développer des thérapies personnalisées contre les infections récidivantes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
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