Association of Peroxisome Proliferator-activated Receptor-gamma Polymorphisms in Lithuanian Patients with Inflammatory Bowel Disease
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The peroxisome proliferator activated receptor gamma (PPARG) is a nuclear receptor highly expressed in the colon and playing a key role in bacterial induced inflammation. Impaired expression of PPARG in colonic epithelial cells in ulcerative colitis (UC) and increased expression in hypertrophic mesenteric adipose tissue in Crohn's disease (CD) have been reported. Recent data showing that PPARG was the major functional receptor mediating the common aminosalicylate activities in inflammatory bowel diseases (IBD) have also reinforced the roles of this receptor in the control of intestinal inflammation. Therefore, any mutation in PPARG gene may be responsible for the increase in inflammatory mediators and hence the perpetuation of inflammation in IBD patients. AIM: to explore two coding polymorphisms in the PPARG gene (rs1801282 and rs2960422) in a Lithuanian IBD population. Material and methods: Two PPARG functional SNPs rs1801282 and rs2960422 were analysed in the study population of 225 IBD patients (UC n=152; mean age: 41.80±17.07; CD n=73; mean age: 35.72±15.38) and 249 unrelated healthy controls (mean age: 43.30±12.39) using ligation-based SNPlex™ genotyping (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) technology. The SNPs were quality-controlled for: genotyping success rate (>90%), allele frequency (>1% in healthy controls), deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (pHWE>0.01 in the control sample). Assessment of all SNPs and single-marker association analyses were performed using the software program Haploview 4.0. Results: Single-marker analysis revealed association between CD and PPARG genetic variant rs1801282 (p=3.26x10-2; OR=1.84, 95% CI:1.05-3.24), whereas no significant association was detected with UC patients. There were no significant differences in frequency of rs1801282 polymorphism in patients with different CD phenotypes according to Montreal classification. For the other PPARG genetic variant rs2960422 no association...
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».