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Enregistrement W7132861660

Common Genetic Variants in CHRNA5 Alter β-amyloid Neuropathology and Highlight Chandelier Cells in Human Aging and Alzheimer’s Disease

2022· dissertation· W7132861660 sur OpenAlexaff
Jonas Rybnicek

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2022
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNicotinic Acetylcholine Receptors Study
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuropathologyNicotinic acetylcholine receptorAlleleContext (archaeology)Nicotinic agonistGenotypeDisease
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Changes in high-affinity nicotinic acetylcholine receptors are connected to cognitive impairment in Alzheimer’s Disease (AD). The nicotinic α5 subunit (coded by CHRNA5) is important for attention and cognition, however its role in the context of aging and neuropathology is unknown. Here, we investigate, in an aged human cohort, the impact two common CHRNA5 polymorphisms: the function-compromising rs16969968 and the expression-altering rs1979905. We observed a significant negative association between the high CHRNA5-expression rs1979905A2 genotype and β-amyloid load. Furthermore, we found that the greatest abundance of CHRNA5 expression was in chandelier cells, a specialized set of interneurons enriched for β-amyloid-binding genes. Finally, we found that in subjects homozygous for the minor allele of the CHRNA5 function-compromising polymorphism rs16969968, chandelier cell proportions in the prefrontal cortex are significantly decreased at high levels β-amyloid levels. Taken together, these findings urge further investigation into the role of CHRNA5 and chandelier cells in AD neuroprotection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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