MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7132868767

NoncanonicalTransmission of Biological Information and Master-regulation of Signaling by the Zinc Finger Proteins MSTR-1 and MSTR-2

2022· dissertation· W7132868767 sur OpenAlexaff
Matthew Emre Eroglu

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2022
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermlineZinc fingerTranscription factorGerm cellEpigeneticsPiwi-interacting RNASignal transductionTranscription (linguistics)Gene silencingRegulation of gene expression
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heritable information is encoded in nucleic acids and transmitted by an immortal germ lineage. Failure of germ cells to clear DNA damage or maintain small RNA expression leads to progressive sterility (germline mortality) over multiple generations due to accumulation of defects such as telomere erosion or transposon mobilization. Here, I show that solid-phase protein amyloids, which I propose to term ‘fluorosomes’ for their intrinsic fluorescence, are inherited transgenerationally and transmit the epigenetic information required for proper germ cell sex determination and germline immortality. I identify two genes, which I term multigenerational sterility and temperature regulated (F22D6.2/mstr-1 and F56F3.4/mstr-2), that when ablated lead to transgenerational accumulation of these fluorosomes and progressive transformation of germ cells from spermatogenic to oogenic fates. Among its key targets, MSTR-1 restricts expression of the sex determinant GLD-1 from spermatogenic cells, whereas in mstr mutants GLD-1 protein but not mRNA accumulates ectopically over several generations, transforming sperm-fated germ cells to oocytes. I further chronicle the discovery of these genes and the work that led to them, from investigation of their roles in cell signaling to the serendipitous discovery of their roles in germline function. Briefly, I show that insulin-like growth factor receptor DAF-2 signaling regulates DAF-16/FOXO dependent and independent networks to modulate LET-60/Ras function in the soma. The FOXO independent mechanism relies on the transcription factor PQM1, which is regulated by the SGK-1 kinase. The transcriptional target of PQM-1, mstr-1, regulates diverse cell signalling pathways important for multiple developmental processes, including vulval cell fate specification, germline proliferation, and longevity. Overall, my work reveals a post-transcriptional transgenerational epigenetic mechanism of trait transmission and demonstrates that germline immortality can be lost independently of DNA or RNA maintenance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTSpace→Même sujetGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms→Travaux en français237 207→