Structural Studies of Histone H3K36 Methyltransferase NSD1 and CRL2 Substrate Receptors FEM1B/C
Notice bibliographique
Résumé
NSD1 is a histone methyltransferase that adds one or two methyl groups to H3K36. Mutations of NSD1 result in Soto’s Syndrome, a neurological disease. FEM1B and FEM1C, substrate receptors of ubiquitin ligase CRL2, specifically recognize proteins with an arginine residue at their C-termini. Dysfunction leads to diseases like Alzheimer’s or ALS. To better understand the disease implications of these proteins, this thesis aims to determine the protein structures of the NSD1 variants (Y1869C/T1927A) and FEM1B/FEM1C in complex with their inhibitors, H3K36M or EN106, respectively. Two crystal structures, NSD1(Y1869C) (PDB 8FBG) and NSD1(T1927A) (PDB 8FBH), have been obtained, which contain the cofactor SAM but not H3K36M. The FEM1B(aa 1-356) and FEM1C(aa 1-244) structures have also been reproduced, but lack the presence of EN106. In the future, the wild-type or mutated nucleosome will be used as substrates in the NSD1 co-crystallization, and more potent FEM1B/C inhibitors would be identified to facilitate co-crystallization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».