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Enregistrement W7132894626

Implications of Degeneracy and Pleiotropy for Homeostatic Regulation of Neuronal Properties

2023· dissertation· W7132894626 sur OpenAlexaff
Jane Yang

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2023
Typedissertation
Langue
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomeostasisDegeneracy (biology)Homeostatic plasticityPleiotropyAllostasisMechanism (biology)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuronal excitability is homeostatically regulated through coordinated adjustments of diverse ion channels. This is possible because the basis for excitability is degenerate—equivalent excitability can be achieved via different ion channels. But one must also consider that ion channels are pleiotropic, meaning that they affect multiple properties. Then how does a neuron co-regulate multiple (degenerate) properties by adjusting pleiotropic channels? The overarching goal of this thesis is to study the implications of pleiotropy and degeneracy for homeostatic regulation of neuronal properties. Using simulations, I showed that successful homeostatic regulation requires that the number of adjustable ion channels (nin) must exceed the number of regulated properties (nout). Those results reveal that homeostatic regulation can fail from having to regulate multiple properties concurrently, which is more challenging than regulating them separately. In collaboration with experimentalists, I conducted simulations to demonstrate that nociceptor excitability is degenerate on the basis of different subtypes of voltage-gated sodium channels (NaVs). This has critical implications for the efficacy of subtype-selective NaV inhibitors: Given that one subtype can compensate for another, the therapeutic effects of blocking NaV1.7 can be offset by compensatory changes in other NaVs (i.e. subversive compensation). I reviewed preclinical and clinical literature on NaV1.7-selective inhibitors to see whether there was evidence for subversive compensation, a possible explanation for why preclinical success did not translate into clinical success. I found that nearly all preclinical studies were single dosing, and would not have observed the effects of subversive compensation. Overall, this thesis shows that degeneracy is an important consideration when trying to understand homeostatic regulation of neuronal excitability under normal and pathological conditions. Indeed, degeneracy predicts that subtype-selective ion channel inhibitors might be particularly prone to having their therapeutic effects subverted by homeostatic regulation of other, non-targeted channels, which is obviously an important yet underappreciated factor in choosing drug targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,124
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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