Detection of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator ∆F508 Gene Mutation Using a Paper-Based Nucleic Acid Hybridization Assay and a Smartphone Camera
Notice bibliographique
Résumé
Diagnostic technology that utilizes paper substrates and device cameras offers opportunities for development of cost effective point-of-care technologies. The translation of assays operating in aqueous solution require further development for implementation in paper substrates. This report presents and compares two methods for determination of oligonucleotides that serve as indicators of Cystic Fibrosis, differentiating wild type and mutant type sequences containing a 3-base deletion. The transduction strategy operates by selective hybridization of dye-labelled oligonucleotides (target or reporters) to capture probes immobilized on quantum dots, and hybridization results in emission of dyes via resonance energy transfer. Detection is based on hybridization of fluorophore labelled target, or hybridization of unlabelled target and labelled reporter in a sandwich assay format. Selectivity to determine mismatched sequences required control of stringency conditions using formamide as a chaotrope. It was determined that both formats can distinguish between wild type and mutant type samples on paper substrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».