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Enregistrement W7132930534

The molecular basis of Hsp70-sulfogalactolipid binding: structure/function of protein and glycolipid components

2002· dissertation· W7132930534 sur OpenAlexfundno aff
Daniel Mamelak

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2002
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésGalactolipidsSulfationGlycolipidSulfotransferaseAmino acidSite-directed mutagenesisBinding siteMutagenesisPeptide sequence
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock/stress proteins of the 70 kD (hsp70) family have been implicated in mediating bacterial/host and sperm/egg interactions via a novel binding-specificity to the sulfated galactolipids (SGL), 3′sulfogalactosylceramide (SGC) and 3′sulfogalactosylglycerolipid(SGG). To investigate the molecular mechanism(s) of sulfated glycolipid recognition by hsp70 we have used a series of sulfated galactolipid derivatives and the recombinant testis-specific hsp70.2 gene product, rP70, as our model system. Thin layer chromatography (tlc) and receptor ELISAs demonstrated rP70 to bind specifically 3′ and 4′ sulfated galactolipids and not any other sulfated or sialic acid containing lipid. Binding to 3 ′SGL was dependent upon a ceramide-based backbone, whereas binding to 4′SGL was observed with either a ceramide or alkyhydrocarbon backbone. Binding of rP70 was not observed to the sulfated sugars heparin or 3′ sulfogalactose, suggesting that the lipid moiety and the sulfate position around the galactose ring of SGL contribute to this specific recognition event. Soluble analogues of SGC consisting of an acyl chain substitution with adamantane and a neoglycoconjugate of SGC and bovine serum albumin have both been demonstrated to function as receptors for rP70, while adamantyl-SGC inhibits rP70/SGL binding in the μM range. Proteolytic cleavage and truncation analysis demonstrated that the SGL binding site is localized within amino acids 300–387 of the highly conserved N-terminal ATPase domain of rP70. Site directed mutagenesis showed arginine 342 and phenylalanine 198 to be critical for SGL binding. Interestingly, these amino acids are conserved among all members of the hsp70 family and the ability to bind SGC/SGG is maintained among recombinant hsp70s from the bacterial pathogens, Chlamydia trachomatis , mycoplasma, Helicobacter pylori and Haemophilus influenzae. DnaK, the most widely studied intracellular chaperone also possesses SGC/SGG binding specificity. The recombinant sea urchin receptor for sperm, a member of the hsp110 family possessing 45% homology with P70, also binds SGC and SGG, extending the role of hsp70-mediated SGL recognition originally proposed in sperm/egg binding. Elucidating the molecular mechanisms of SGL recognition by hsp70 provides the basis for the rational design of specific protein, glycolipid and neogylcoconjugate compounds that may be effective in inhibiting the hsp70 adhesin function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2002
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Résumé présentoui

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