Notice bibliographique
Résumé
Previous research has established that HIV-1 gene expression is sensitive to modulations made to trans-acting host factors Serine-Arginine (SR) protein. Cdc2-like kinases (CLK1 - 4) that phosphorylate SR proteins, exhibit >89% sequence similarity within their kinase domain. However, when overexpressed, HIV-1 Gag expression is enhanced by CLK1, reduced by CLK2, while CLK3 and -4 had no significant effect. This thesis explores the roles of the CLK domains in regulating HIV-1 gene expression. Analysis of CLK chimeras revealed that the RS domain of CLK1 and 2 influenced activity, dependent on the kinase domain. Furthermore, deletion analysis of the CLK RS domain revealed functional differences; mutants CLK1-∆2 and CLK1-∆3 had opposing effects on HIV-1 gene expression, in contrast, the entire RS domain was required for CLK2 function. Utilizing miniTurbo-CLK fusions proteins and TMT-MS, quantitative comparisons of CLK1-WT, CLK1-∆2, CLK1-∆3 and CLK2-WT interactomes identified a small subset of interactions that preferentially associated with the CLKs, providing insight into the observed functional differences.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».