MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7132976798

Cell and molecular biological studies of the hypersensitive response induced in cowpea by the cowpea rust fungus

2002· dissertation· W7132976798 sur OpenAlexfundno aff
Michael J. R. Mould

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2002
Typedissertation
Langue
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAgricultural pest management studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Toronto
Mots-clésHypersensitive responseFungusRust (programming language)Plant cellCytoplasmPathogenGeneCellPathogenic fungus
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A cytological and molecular biological approach was undertaken to examine the events that occur during the very early stages of the hypersensitive response (HR) in cowpea midvein epidermal cells that are being infected by the cowpea rust fungus. The HR is one of the most-ubiquitous defense responses that plants exhibit in response to pathogen infection and has been defined as the rapid, localized cell death in association with disease resistance. For the cytological portion of the study, stereological ultrastructural analyses of rust fungus infected and uninfected midvein epidermal cells from resistant and susceptible plants indicated that transcription and translation were up-regulated in the cells of the resistant plant while the fungus was penetrating through the plant cell wall, and prior to fungal contact with the plant plasma membrane. Conversely, in the rust-susceptible cells, there was evidence that decreases in transcription and translation occurred in the rust fungus-infected cells at this same stage of infection. To identify genes that were up-regulated in the rust resistant cowpea cells during this very early stage of the penetration process, cytoplasm was extracted from individual epidermal cells of rust fungus-inoculated and uninoculated plants that were either resistant or susceptible to the fungus. RNA was isolated from each of the extracted cell types and amplified in a non-gene-specific manner in order to generate a 3′ EST library for each of the four cell types. Differential screening of the library generated from the infected-resistant cells resulted in the identification of three overall groups of genes. These were genes that were up-regulated in both the infected-resistant and -susceptible cells, those that appeared to be suppressed in the infected-susceptible plants and those that were up-regulated only in the infected-resistant cells. Genes in the latter situation differed from those reported previously for studies of the HR that involved sample tissue including both living cells and those advanced in the death process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,919
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTSpaceMême sujetAgricultural pest management studiesTravaux en français237 207