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Enregistrement W7132989181

Localization of Heat Shock Proteins HSPA6 (HSP70B') and HSPA1A (HSP70-1) in Cultured Differentiated Human Neuronal Cells Following Thermal Stress

2014· dissertation· W7132989181 sur OpenAlexfundno aff
Sam Khalouei

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2014
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto ScarboroughNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNucleolusRNAHeat shock proteinCytoplasmRNA-binding proteinStress granuleNuclear localization sequenceCell nucleusNuclear proteinHeat shock
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock proteins (Hsps) are a set of highly conserved proteins that are involved in cellular repair and protective mechanisms. In order to identify stress-sensitive sites in differentiated human neuronal cells, cytoplasmic and nuclear localization of two inducible members of the HSPA (HSP70) family was investigated, namely HSPA6 (HSP70B') and HSPA1A (HSP70-1). Stably transfected SH-SY5Y neuronal cell lines were generated that express YFP-HSPA6 and YFP-HSPA1A proteins. Following differentiation, transfected SH-SY5Y cells were exposed to mild heat shock at 43째C for 20 min. Immediately following heat shock, YFP-tagged HSPA6 and HSPA1A proteins localized to centrioles in the cytoplasm and nuclear speckles that are enriched in RNA splicing factors. Subsequently, both stress proteins associated with the granular component of the nucleolus which is the site of ribosomal subunit assembly and ribosomal RNA processing. Later in the recovery period, YFP-HSPA6 protein, but not YFP-HSPA1A, localized to the periphery of nuclear speckles that are sites of RNA transcription and RNA splicing. The present results identify centrioles, nuclear speckles, and the GC component of the nucleolus as potential stress-sensitive sites in differentiated human neuronal cells. The inducible HSPA6 and HSPA1A proteins exhibit similar localization to these sites. The unique association of the HSPA6 protein with the periphery of nuclear speckles identifies this nuclear site as being stress sensitive, and suggests that the little studied HSPA6 protein may be involved in the recovery of RNA transcription and/or splicing. HSPA6 is a strictly inducible protein, whose gene is present in the human genome but not in rat and mouse. Hence current animal models of neurodegenerative diseases are lacking a potentially protective member of the HSPA family. Sequence and structural analysis revealed that HSPA6 has three additional cysteine amino acids compared to HSPA1A. One of these cysteine amino acids, located in the linker domain, is not found in any other member of the human HSPA family. Identification of stress-sensitive sites in differentiated human neuronal cells could aid the design of therapeutic approaches to protect neurons from the progression of neurodegenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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