Notice bibliographique
Résumé
Recombination, the shuffling of alleles during meiosis, is a fundamental evolutionary process that is nearly ubiquitous across eukaryotes. By uncoupling linkage disequilibrium between harmful and beneficial mutations, recombination promotes more effective selection. However, recombination rate varies at multiple scales across nature, which has important implications for genome evolution at large. Here, I report four chapters that investigate recombination and genome evolution using the unicellular and facultatively sexual chlorophyte Chlamydomonas reinhardtii. I examine recombination rate variation at the level of populations, individuals, and across the genome itself. I show that recombination rates are consistent between populations and individuals, demonstrate evidence that recombination plays a role in reducing the effects of selection at linked sites, and estimate the rate of sexual reproduction in a wild population of C. reinhardtii. I also investigate recombination in a crossover-suppressed sex-determining region of the genome, and show how noncrossover recombination can still maintain effective selection, thus preventing long-term degeneration of these loci. Finally, I close off with a study pertaining to mutational biases introduced by environmental stressors in C. reinhardtii and demonstrate the effects of the former on adaptation. Altogether, my thesis addresses fundamental questions regarding recombination rate variation and adaptation in C. reinhardtii, and alongside existing detailed work on spontaneous mutation in the system, provides an empirical framework for understanding how these processes affect genome evolution over evolutionary time.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».