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Enregistrement W7133043706

In vitro characterization of the acute promyelocytic leukemia variant fusion oncoprotein NuMA-RARalpha

2007· dissertation· W7133043706 sur OpenAlexaff
Soheila A. Hamadanizadeh

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2007
Typedissertation
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcute promyelocytic leukemiaFusion proteinRetinoic acidPsychological repressionFusion geneTranscription factorTranscriptional regulationTranscription (linguistics)Gene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute promyelocytic leukemia (APL) is characterized by the presence of gene rearrangements involving the retinoic acid receptor a (RARalpha) gene locus on chromosome 17. These rearrangements result in the formation of X-RARalpha fusion oncoproteins which act as aberrant transcriptional repressors, thus making APL a model disease in which to study the role of aberrant transcriptional repression in tumongenesis. Our group identified two variant X-RARalpha---NPM-RARalpha and NuMA-RARalpha---during the last decade. Here, we characterize these variant fusion proteins, in comparison with PML-RARa and PLZF-RARalpha, in terms of their DNA binding properties and ability to repress transcription from the retinoic acid and peroxisome proliferator response elements. Our data suggest a role for X-RARalpha in inhibiting signaling through the PPARgamma/PPRE pathway, consistent with recent evidence for the deregulation of pathways external to retinoid signaling during APL pathogenesis. Our data also indicate that X-RARalpha fusions may fall into two distinct classes in their ability to bind to the RARE and PPRE and to activate ligand-responsive genes. Furthermore, we show that NuMA-RARalpha is capable of causing ligand-dependent transcriptional super-activation at both RAREs and PPREs, exhibiting a property that is unique among the X-RARalpha fusion proteins. We went on to develop the U937/NuMA-RARalpha stable cell line, the first cell culture system expressing this fusion. We report that NuMA-RARalpha was stably expressed at the protein level, and found in both the cytoplasm and nucleus. Furthermore, NuMA-RARalpha did not appear to interfere with localization of NuMA to the mitotic spindle. We found that the PPARgamma ligand troglitazone (TZ) can inhibit the cellular proliferation of cells expressing NuMA-RARa by induction of apoptosis. We validated these findings in an ex vivo system, by demonstrating induction of apoptosis in hCG-NuMA-RARa transgenic mouse LTMCs in response to TZ. Apoptosis in these cells is due to activation of both receptor-mediated and mitochondrial pathways, operating through caspases-8 and -9. This effect of troglitazone was not limited to NuMA-RARalpha, and was not species or cell type specific, thus implicating it as a possible alternative therapy in APL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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