Functional Analysis of the Contribution of HIF-1α Proline 402 to the Interaction with VHL
Notice bibliographique
Résumé
Hypoxia-inducible factor 1 alpha (HIF-1α) is involved in transcription of hypoxia-inducible genes. In normoxia, it binds von Hippel-Lindau (VHL) resulting in ubiquitin-proteasome degradation. This requires hydroxylation at prolines 564 (P564) or 402 (P402) within the oxygen-dependent degradation (ODD) domain. P402 hydroxylation only occurs at higher oxygen concentrations. Its specific contribution to the HIF-1α-VHL interaction is unknown. It was hypothesized that loss of P402 in normoxia will dampen the HIF-1α-VHL interaction. HA-tagged ODD constructs (WT, P402A, P564G, and P402A/P564G) were generated. FLAG-VHL co-immunoprecipitation was lower for P402A compared to WT. In vitro ubiquitination decreased with P402 mutation when P564 was also mutated. Cycloheximide chase analysis showed that P402 loss had no significant effect on ODD half-life. These results indicate a secondary role for P402 in the HIF-1alpha-VHL interaction. Elucidating the details of P402’s role in the interaction of HIF-1alpha with VHL will enhance the understanding of mammalian oxygen sensing and ubiquitin-proteasome pathways.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».