Notice bibliographique
Résumé
Post-translational modifications with ubiquitin chains represent a dynamic, reversible mechanism for regulating protein fate and signaling pathways. The signaling pathways governed by linear ubiquitin (Met1-Ub) chains and the associated biological roles are still emerging. In vertebrates, Met1-Ub chains are built by the Linear Ubiquitin Assembly Complex (LUBAC), and its catalytic subunit HOIP. OTU deubiquitinase With Linear Linkage Specificity (OTULIN), also called GUMBY or FAM105B, selectively hydrolyzes Met1-Ub chains and directly associates with HOIP. Here, I describe novel roles for OTULIN in PCP signaling and Parkin-mediated mitophagy. I show that in PCP signaling, OTULIN protein interactions can direct LUBAC recruitment, as well as Met1-Ub target and pathway choice. Met1-Ub, which has been previously shown to control protein activity or stability, can also direct the surface presentation of transmembrane proteins. I show that OTULIN is involved in Parkin recruitment to mitochondria. In addition, HOIP recruits Parkin to mitochondria and co-localizes with Parkin at mitochondria. My work contributes to the short list of known LUBAC targets that are modified with Met1-Ub chains. My research also expands the role of OTULIN in Parkin-dependent mitophagy, contributing to unexplored cellular functions of OTULIN and LUBAC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».