Should routine testing for Candidozyma auris be implemented in Canadian healthcare facilities?
Notice bibliographique
Résumé
Candidozyma auris (C. auris) is an emerging human fungal pathogen that was first discovered from a human external ear specimen from Japan in 2009 (Satoh et al. 2009 and Lockhart et al. 2023). However, a subsequent retrospective study found infections with C. auris as early as 1996 in South Korea initially misidentified as Candidozyma haemuli (Lee et al. 2011). The fungus has rapidly spread across six continents (Ahmad & Asadzadeh, 2023; World Health Organization [WHO], 2022). Extensive transmission has occurred in South Asia, South America, South Africa, and United States with some areas considered endemic (Jackson et al. 2019; Geremia et al. 2023; Reiner-McAfee et al. 2021; WHO, 2022). Analyses of genetic divergence between C. auris clades suggest that the pathogen likely emerged simultaneously in multiple locations globally (Akinbobola et al. 2023; Lockhart et al. 2017). Considering its thermotolerance (it can be cultured at temperatures as high as 42°C), climate change may have played a role in the evolution of C. auris as a human pathogen. (Ahmad & Asadzadeh, 2023; Jackson et al. 2019; WHO, 2022). Another factor in its emergence is the widespread use of antifungals in agriculture exerting a selective pressure on environmental yeasts (Akinbobola et al. 2023; WHO, 2022; WHO, 2025).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,016 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».