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Enregistrement W7160567522

OP367 - Evidence from Mitochondrial DNA Sequences Suggest a Recent Origin for Peromyscus truei comanche

2020· article· en· W7160567522 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThinkTech (Texas Tech University) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesPhylogenetic treePopulationMitochondrial DNAGenetic divergenceDendrogramPhylogeneticsGenetic distance
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Isolated populations of Peromyscus truei comanche occur in the Tule and Palo Duro Canyon region of the Texas Panhandle.Four plausible routes that may explain the current distribution of the pion mouse were investigated herein by comparing the phylogenetic relationships of P. t. comanche with eight other subspecies of P. truei from throughout the western and southwestern United States and the Baja Peninsula of Mexico.To determine the origin and affiliation of P. t. comanche populations, DNA sequence data were obtained from the mitochondrial cytochrome-b gene (1,143 bp) and displacement loop (971 bp) and analyzed in a phylogenetic context.Results of the Bayesian inference analyses indicated that samples of P. t. comanche genetically were undifferentiated from two of the eight subspecies of P. truei (P.t. nevadensis and P. t. truei).Overall, genetic divergence values, obtained from the cytochrome-b gene, ranged from 1.16% to 4.99% between P. t. comanche and the other eight subspecies of P. truei.Peromyscus truei comanche differed genetically from the nearest population of P. t. truei (Glenrio, Texas) by 1.73%; however, samples of P. t. comanche were differentiated from individual populations of P. t. truei from Mills Canyon, New Mexico, Black Mesa, Oklahoma, and Guadalupe Mountains National Park, Texas by 0.79%, 1.00%, and 2.00%, respectively.Although results of the phylogenetic analyses were unable to definitively explain the origin of P. t. comanche, levels of genetic divergence suggest a recent evolutionary history with samples from Mills Canyon, New Mexico.Results from the divergence dating analyses suggest that P. t. comanche from the Texas Panhandle diverged from a source-stock population in northeastern New Mexico approximately 0.71 mya.This infers an expansion route (Route II) from Mills Canyon, New Mexico, along canyonlands associated with the Canadian River system to the northeastern edge of the Llano Estacado, and subsequent isolation and divergence of P. t. comanche from its P. t. truei-like ancestor; whereas the closest extant populations of P. t. truei in Glenrio, Texas genetically were more divergent (1.73%), and also would have required dispersal across the inhospitable landscape (for P. truei) of the Llano Estacado.Finally, P. t. comanche did not form a monophyletic group (to the exclusion of other samples of P. t. truei) in the genetic analyses, however the significant levels of morphological differentiation reported in other studies justifies its retention as a valid subspecies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,840
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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