OP367 - Evidence from Mitochondrial DNA Sequences Suggest a Recent Origin for Peromyscus truei comanche
Notice bibliographique
Résumé
Isolated populations of Peromyscus truei comanche occur in the Tule and Palo Duro Canyon region of the Texas Panhandle.Four plausible routes that may explain the current distribution of the piñon mouse were investigated herein by comparing the phylogenetic relationships of P. t. comanche with eight other subspecies of P. truei from throughout the western and southwestern United States and the Baja Peninsula of Mexico.To determine the origin and affiliation of P. t. comanche populations, DNA sequence data were obtained from the mitochondrial cytochrome-b gene (1,143 bp) and displacement loop (971 bp) and analyzed in a phylogenetic context.Results of the Bayesian inference analyses indicated that samples of P. t. comanche genetically were undifferentiated from two of the eight subspecies of P. truei (P.t. nevadensis and P. t. truei).Overall, genetic divergence values, obtained from the cytochrome-b gene, ranged from 1.16% to 4.99% between P. t. comanche and the other eight subspecies of P. truei.Peromyscus truei comanche differed genetically from the nearest population of P. t. truei (Glenrio, Texas) by 1.73%; however, samples of P. t. comanche were differentiated from individual populations of P. t. truei from MillsCanyon, New Mexico, Black Mesa, Oklahoma, and Guadalupe Mountains National Park, Texas by 0.79%, 1.00%, and 2.00%, respectively.Although results of the phylogenetic analyses were unable to definitively explain the origin of P. t. comanche, levels of genetic divergence suggest a recent evolutionary history with samples from Mills Canyon, New Mexico.Results from the divergence dating analyses suggest that P. t. comanche from the Texas Panhandle diverged from a source-stock population in northeastern New Mexico approximately 0.71 mya.This infers an expansion route (Route II) from Mills Canyon, New Mexico, along canyonlands associated with the Canadian River system to the northeastern edge of the Llano Estacado, and subsequent isolation and divergence of P. t. comanche from its P. t. truei-like ancestor; whereas the closest extant populations of P. t. truei in Glenrio, Texas genetically were more divergent (1.73%), and also would have required dispersal across the inhospitable landscape (for P. truei) of the Llano Estacado.Finally, P. t. comanche did not form a monophyletic group (to the exclusion of other samples of P. t. truei) in the genetic analyses, however the significant levels of morphological differentiation reported in other studies justifies its retention as a valid subspecies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».