Epidemiologic investigation of the value of human papillomavirus (HPV) testing and genotyping in cervical cancer screening in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Le dépistage du cancer du col de l’utérus par analyse de frottis cytologique ou test de Papanicolaou, communément appelé test Pap, a été introduit au Canada il y a de cela plusieurs décennies. Cette mesure a permis de réduire de façon considérable tant le taux d’incidence que le taux de mortalité de ce cancer. Ces taux se sont toutefois stabilisés au cours des dernières années; des gains importants reliés à ce type de dépistage sont donc peu probables. La faible sensibilité du test Pap de même que les coûts élevés des infrastructures et du personnel nécessaires au maintien de ce programme demeurent des limites bien réelles. Depuis que l’on sait que tous les cancers du col sont causés par une infection au virus du papillome humain (VPH) de type oncogène, des avancées spectaculaires ont été réalisées en matière de prévention, à un point tel que l’utilité et l’efficacité des stratégies déjà en place au Canada et ailleurs dans le monde sont maintenant remises en question.L’objectif général de la présente recherche doctorale est de déterminer la valeur clinique du test de détection de VPH oncogène chez des femmes canadiennes testées pour le cancer du col de l’utérus de façon régulière. Les données provenant de l’étude Canadian Cervical Cancer Screening Trial (CCCaST; n = 10,154) ont été utilisées afin de répondre aux objectifs suivants : 1) évaluer au cours d’une période de 36 mois les habiletés du test VPH et du test Pap (de façon séparée et conjointe) à détecter les néoplasies cervicales intraépithéliales (CIN) de haut grade et le cancer du col; 2) déterminer la valeur pronostique du test VPH et du test Pap (de façon séparée et conjointe) pour détecter les CIN de haut grade et le cancer du col sur une période de 120 mois; 3) examiner dans quelle mesure la détection de différents types de VPH pourrait améliorer la stratification des risques pour la détection des CIN de haut grade et du cancer du col chez les femmes dont le test VPH est positif.Dans cette thèse, les habiletés prédictives du test VPH et du test Pap pour détecter les CIN ont été comparées avec la méthode de Kaplan-Meier, le test du log-rank, et un modèle de Cox multivarié, et ce pour deux périodes distinctes, soit celle définie par le protocole et celle incluant un suivi prolongé. Une version plus flexible du modèle de Cox permet de tester simultanément les hypothèses à confirmer imposées par l’utilisation d’un modèle conventionnel : la proportionnalité des taux de survie (hazard ratio/HR), et la linéarité entre les prédicteurs continus et le logarithme du taux de survie. Si au moins une de ces hypothèses se révélait fausse, des modèles tenant compte de la non-proportionnalité ou de la non-linéarité étaient utilisés. Les performances de différentes stratégies de dépistage basées sur le test VPH, le test Pap, et la référence en colposcopie des femmes ayant un test positif au VPH ont également été comparées.Le travail effectué dans le cadre de cette dissertation démontre que le dépistage du cancer du col incorporant le test VPH permet une meilleure détection de ce cancer que le test Pap utilisé seul chez les femmes ≥30 ans, ce qui réduit ainsi la fréquence de dépistage. L’introduction du test VPH augmenterait la valeur prédictive positive de ce dépistage. Le test VPH comme mesure de prévention primaire donne des résultats comparables et rassure davantage sur les risques de développement du cancer que les stratégies de dépistage du moment. Les inquiétudes face au test VPH comme mesure de prévention primaire, en particulier sa spécificité, peuvent être atténuées en faisant un tri des femmes ayant un test positif au VPH, et en leur réservant l’analyse cytologique et un suivi plus accru. Finalement, en raison de la violation des hypothèses de la proportionnalité des HR, les estimations du modèle de Cox conventionnel sous-estiment considérablement les HR ajustés associés à un test VPH oncogène positif, utilisé seul ou avec le test Pap, et ce dès le début du suivi.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».