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Record W7161762928 · doi:10.82308/8414

Epidemiologic investigation of the value of human papillomavirus (HPV) testing and genotyping in cervical cancer screening in Canada

2018· dissertation· en· W7161762928 on OpenAlexaboutno aff
Sandra Isidean

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicCervical Cancer and HPV Research
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsHuman papillomavirusCervical cancerCervical cancer screeningMedical screeningUterine cervixCancerAscus (bryozoa)

Abstract

fetched live from OpenAlex

Le dépistage du cancer du col de l’utérus par analyse de frottis cytologique ou test de Papanicolaou, communément appelé test Pap, a été introduit au Canada il y a de cela plusieurs décennies. Cette mesure a permis de réduire de façon considérable tant le taux d’incidence que le taux de mortalité de ce cancer. Ces taux se sont toutefois stabilisés au cours des dernières années; des gains importants reliés à ce type de dépistage sont donc peu probables. La faible sensibilité du test Pap de même que les coûts élevés des infrastructures et du personnel nécessaires au maintien de ce programme demeurent des limites bien réelles. Depuis que l’on sait que tous les cancers du col sont causés par une infection au virus du papillome humain (VPH) de type oncogène, des avancées spectaculaires ont été réalisées en matière de prévention, à un point tel que l’utilité et l’efficacité des stratégies déjà en place au Canada et ailleurs dans le monde sont maintenant remises en question.L’objectif général de la présente recherche doctorale est de déterminer la valeur clinique du test de détection de VPH oncogène chez des femmes canadiennes testées pour le cancer du col de l’utérus de façon régulière. Les données provenant de l’étude Canadian Cervical Cancer Screening Trial (CCCaST; n = 10,154) ont été utilisées afin de répondre aux objectifs suivants : 1) évaluer au cours d’une période de 36 mois les habiletés du test VPH et du test Pap (de façon séparée et conjointe) à détecter les néoplasies cervicales intraépithéliales (CIN) de haut grade et le cancer du col; 2) déterminer la valeur pronostique du test VPH et du test Pap (de façon séparée et conjointe) pour détecter les CIN de haut grade et le cancer du col sur une période de 120 mois; 3) examiner dans quelle mesure la détection de différents types de VPH pourrait améliorer la stratification des risques pour la détection des CIN de haut grade et du cancer du col chez les femmes dont le test VPH est positif.Dans cette thèse, les habiletés prédictives du test VPH et du test Pap pour détecter les CIN ont été comparées avec la méthode de Kaplan-Meier, le test du log-rank, et un modèle de Cox multivarié, et ce pour deux périodes distinctes, soit celle définie par le protocole et celle incluant un suivi prolongé. Une version plus flexible du modèle de Cox permet de tester simultanément les hypothèses à confirmer imposées par l’utilisation d’un modèle conventionnel : la proportionnalité des taux de survie (hazard ratio/HR), et la linéarité entre les prédicteurs continus et le logarithme du taux de survie. Si au moins une de ces hypothèses se révélait fausse, des modèles tenant compte de la non-proportionnalité ou de la non-linéarité étaient utilisés. Les performances de différentes stratégies de dépistage basées sur le test VPH, le test Pap, et la référence en colposcopie des femmes ayant un test positif au VPH ont également été comparées.Le travail effectué dans le cadre de cette dissertation démontre que le dépistage du cancer du col incorporant le test VPH permet une meilleure détection de ce cancer que le test Pap utilisé seul chez les femmes ≥30 ans, ce qui réduit ainsi la fréquence de dépistage. L’introduction du test VPH augmenterait la valeur prédictive positive de ce dépistage. Le test VPH comme mesure de prévention primaire donne des résultats comparables et rassure davantage sur les risques de développement du cancer que les stratégies de dépistage du moment. Les inquiétudes face au test VPH comme mesure de prévention primaire, en particulier sa spécificité, peuvent être atténuées en faisant un tri des femmes ayant un test positif au VPH, et en leur réservant l’analyse cytologique et un suivi plus accru. Finalement, en raison de la violation des hypothèses de la proportionnalité des HR, les estimations du modèle de Cox conventionnel sous-estiment considérablement les HR ajustés associés à un test VPH oncogène positif, utilisé seul ou avec le test Pap, et ce dès le début du suivi.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: Observational
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.034
Threshold uncertainty score0.248

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.006
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0020.006
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0020.000
Open science0.0010.001
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0020.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.094
GPT teacher head0.371
Teacher spread0.277 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2018
Admission routes1
Has abstractyes

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