MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7161779080 · doi:10.82308/7087

Epigenetic responses to oil exposure in wild Arctic seabird populations

2023· dissertation· en· W7161779080 sur OpenAlexaboutno aff
Wing‐Zheng Ho

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationPopulation structureIle de franceEnvironmental factorArctic

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La pollution d'origine anthropique a été démontrée comme ayant des effets néfastes sur la physiologie, le comportement et la fitness des organismes, mais les mécanismes génomique sous-jacents à ces effets ne sont pas bien compris. La régulation épigénétique, telle que la méthylation de l'ADN, a été proposée comme un mécanisme potentiel médiant ces effets, mais actuellement, il existe peu d'études dans les populations naturelles. Dans cette étude, j'ai examiné les schémas de méthylation des tissus hépatiques du guillemot à miroir (Cepphus grylle) dans des régions de l'Arctique canadien présentant des histoires différentes d'exposition aux composés aromatiques polycycliques (CAP). Par rapport à un site témoin, j'ai observé que les trois sites exposés aux CAP partagent un ensemble central de régions différentiellement méthylées (DMRs), ce qui implique qu'il existe des réponses de méthylation cohérentes à ces composés. Cependant, les deux sites exposés à une exposition à court terme à des sources anthropiques de CAP partagent plus de DMRs entre eux qu'avec le site soumis à une exposition chronique aux CAP naturels. De plus, j'ai constaté que, par rapport à un site de contrôle sans exposition aux CAP, les populations exposées à des CAP d'origine anthropique se caractérisent par des DMRs avec des ratios significativement plus élevés de hyperméthylation par rapport à l'hypométhylation par rapport à la population exposée chroniquement aux CAP naturels. Dans l'ensemble, ces résultats impliquent que la composition spécifique et la durée d'exposition aux CAP peuvent influencer la direction de la réponse épigénétique. Cette étude offre de nouvelles perspectives sur les mécanismes épigénétiques sous-jacents aux réponses biologiques à la pollution pétrolière d'origine anthropique. Les DMRs identifiées servent de ressource génomique pour des recherches ultérieures visant à étudier le rôle fonctionnel de la méthylation de l'ADN en réponse à la pollution pétrolière d'origine anthropique

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,061

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetEpigenetics and DNA Methylation→Travaux en français237 207→