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Record W7161779080 · doi:10.82308/7087

Epigenetic responses to oil exposure in wild Arctic seabird populations

2023· dissertation· en· W7161779080 on OpenAlexaboutno aff
Wing‐Zheng Ho

Bibliographic record

Venuenot available
Typedissertation
Languageen
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicEpigenetics and DNA Methylation
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsPopulationPopulation structureIle de franceEnvironmental factorArctic

Abstract

fetched live from OpenAlex

La pollution d'origine anthropique a été démontrée comme ayant des effets néfastes sur la physiologie, le comportement et la fitness des organismes, mais les mécanismes génomique sous-jacents à ces effets ne sont pas bien compris. La régulation épigénétique, telle que la méthylation de l'ADN, a été proposée comme un mécanisme potentiel médiant ces effets, mais actuellement, il existe peu d'études dans les populations naturelles. Dans cette étude, j'ai examiné les schémas de méthylation des tissus hépatiques du guillemot à miroir (Cepphus grylle) dans des régions de l'Arctique canadien présentant des histoires différentes d'exposition aux composés aromatiques polycycliques (CAP). Par rapport à un site témoin, j'ai observé que les trois sites exposés aux CAP partagent un ensemble central de régions différentiellement méthylées (DMRs), ce qui implique qu'il existe des réponses de méthylation cohérentes à ces composés. Cependant, les deux sites exposés à une exposition à court terme à des sources anthropiques de CAP partagent plus de DMRs entre eux qu'avec le site soumis à une exposition chronique aux CAP naturels. De plus, j'ai constaté que, par rapport à un site de contrôle sans exposition aux CAP, les populations exposées à des CAP d'origine anthropique se caractérisent par des DMRs avec des ratios significativement plus élevés de hyperméthylation par rapport à l'hypométhylation par rapport à la population exposée chroniquement aux CAP naturels. Dans l'ensemble, ces résultats impliquent que la composition spécifique et la durée d'exposition aux CAP peuvent influencer la direction de la réponse épigénétique. Cette étude offre de nouvelles perspectives sur les mécanismes épigénétiques sous-jacents aux réponses biologiques à la pollution pétrolière d'origine anthropique. Les DMRs identifiées servent de ressource génomique pour des recherches ultérieures visant à étudier le rôle fonctionnel de la méthylation de l'ADN en réponse à la pollution pétrolière d'origine anthropique

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Observational · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.031
Threshold uncertainty score0.061

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.029
GPT teacher head0.323
Teacher spread0.294 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designObservational
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2023
Admission routes1
Has abstractyes

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